RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Компьютерные исследования и моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Компьютерные исследования и моделирование, 2009, том 1, выпуск 4, страницы 437–448 (Mi crm659)  

АНАЛИЗ И МОДЕЛИРОВАНИЕ СЛОЖНЫХ ЖИВЫХ СИСТЕМ

Моделирование конформационного перехода в фотосинтетическом реакционном центре бактерии Rb. sphaeroides

П. А. Мамонов, П. М. Красильников, П. П. Нокс, А. Б. Рубин

Биологический факультет МГУ им. М. В. Ломоносова, кафедра биофизики, 119991, Москва, Ленинские горы, д. 1, корп. 12

Аннотация: Методом квантово-химического моделирования исследован возможный конформационный переход в локальном окружении первичного хинона в фотосинтетическом реакционном центре (РЦ) бактерии Rhodobacter sphaeroides, сопровождающий процесс переноса электрона. Исходя из представления о наличии двух устойчивых конформационных состояний РЦ, предложена кинетическая модель, хорошо описывающая экспериментальные температурные зависимости скорости реакции рекомбинации $\mathrm{P}^+\mathrm{Q}_A^- \to \mathrm{PQ}_A$. Результаты квантово-химического моделирования сайта связывания первичного хинона позволяют предложить на роль указанного конформационного изменения небольшое смещение кольца убихинона, приводящее к разрыву водородной связи, образуемой 4-C=O группой убихинона с гистидином $\mathrm{M}^{219}$, и образованию новой водородной связи с гидроксильной группой треонина $\mathrm{M}^{222}$. Значения параметров модели, полученные с помощью квантово-химических расчетов, качественно согласуются со значениями параметров кинетической модели, используемых для описания реакции рекомбинации.

Ключевые слова: Rhodobacter sphaeroides, фотосинтетический центр, конформационный переход, реакция рекомбинации.

DOI: https://doi.org/10.20537/2076-7633-2009-1-4-437-448

Полный текст: PDF файл (2636 kB)
Полный текст: http://crm.ics.org.ru/.../1604
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
Поступила в редакцию: 22.04.2009
Исправленный вариант: 01.07.2009

Образец цитирования: П. А. Мамонов, П. М. Красильников, П. П. Нокс, А. Б. Рубин, “Моделирование конформационного перехода в фотосинтетическом реакционном центре бактерии Rb. sphaeroides”, Компьютерные исследования и моделирование, 1:4 (2009), 437–448

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{MamKraKno09}
\by П.~А.~Мамонов, П.~М.~Красильников, П.~П.~Нокс, А.~Б.~Рубин
\paper Моделирование конформационного перехода в фотосинтетическом реакционном центре бактерии Rb. sphaeroides
\jour Компьютерные исследования и моделирование
\yr 2009
\vol 1
\issue 4
\pages 437--448
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/crm659}
\crossref{https://doi.org/10.20537/2076-7633-2009-1-4-437-448}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/crm659
  • http://mi.mathnet.ru/rus/crm/v1/i4/p437

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Компьютерные исследования и моделирование
    Просмотров:
    Эта страница:20
    Полный текст:4
    Литература:7
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019