RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 091, 16 страниц (Mi ipmp2451)  

The study of the torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules

[Исследование торсионных углов между осями спиралей в спиральных парах белковых молекул]

D. A. Tikhonov, L. I. Kulikova, A. V. Efimov


Аннотация: В данной работе проведен анализ распределения торсионных углов между осями спиралей в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Исследование проводилось на множестве спиральных пар, отобранных из структур белковых молекул, представленных в PDB. Полученное множество спиральных пар было проанализировано и разбито на три подмножества по критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей. Показано, что распределение всех типов спиральных пар, не имеющих пересечений проекций спиралей, в зависимости от торсионного угла охватывает практически весь диапазон углов с двумя пиками в области 0$^\circ$ и 180$^\circ$. Распределение спиральных пар подмножества с пересечением проекций спиралей имеет максимум в области значений торсионного угла между осями спиралей в области 20$^\circ$–25$^\circ$. Образованные двумя $\alpha$-спиралями спиральные пары составляют абсолютное большинство пар подмножества с пересечением проекций и осей спиралей. Для них характерно распределение с тремя максимумами, лежащими в области острых углов: в области отрицательных значений (от –50$^\circ$ до –25$^\circ$), в области положительных значений углов (от 20$^\circ$ до 25$^\circ$) и в области прямого угла (от 70$^\circ$ до 110$^\circ$).

Ключевые слова: структурные мотивы, точечная модель, спиральные пары в белковых молекулах, торсионный угол между осями спиралей.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 16-01-00692_a
18-07-01031_а
Российская академия наук - Федеральное агентство научных организаций 0017-2018-0013
The study was made with the support from the RFBR (projects 16-01-00692-a and 18-07-01031-а, within the framework of the state task (0017-2018-0013).


DOI: https://doi.org/10.20948/prepr-2018-91-e

Полный текст: PDF файл (1056 kB)
Полный текст: http:/.../preprint.asp?id=2018-91&lg=r
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Препринт
Язык публикации: английский

Образец цитирования: D. A. Tikhonov, L. I. Kulikova, A. V. Efimov, “The study of the torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 091, 16 pp.

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TikKulEfi18}
\by D.~A.~Tikhonov, L.~I.~Kulikova, A.~V.~Efimov
\paper The study of the torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules
\jour Препринты ИПМ им.~М.~В.~Келдыша
\yr 2018
\papernumber 091
\totalpages 16
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/ipmp2451}
\crossref{https://doi.org/10.20948/prepr-2018-91-e}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/ipmp2451
  • http://mi.mathnet.ru/rus/ipmp/y2018/p91

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Препринты Института прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН
    Просмотров:
    Эта страница:13
    Полный текст:7

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019