RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор
Правила для авторов

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ., 2015, том 8, выпуск 4, страницы 487–496 (Mi jsfu452)  

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

An efficient water model for large scale molecular dynamics simulations

[Эффективная модель воды для моделирования больших молекулярных систем]

Viktor E. Zalizniakab

a Institute of Mathematics and Computer Science, Siberian Federal University, Svobodny, 79, Krasnoyarsk, 660041, Russia
b Institute of Computational Modelling SB RAS, Akademgorodok, 50/44, Krasnoyarsk, 660036, Russia

Аннотация: В статье предлагается простая и эффективная, с вычислительной точки зрения, модель воды. Эта одноточечная модель включает в себя потенциал Леннард-Джонса и усреднённое по углам диполь-дипольное взаимодействие. Для параметризации модели используются экспериментальные данные для воды при различных температурах. Основным целевым параметром была выбрана плотность воды. Параметризация проводилась в области температур от 300 до 350 K и давлений до 10.1 МПа. Свойства воды, вычисленные с помощью предлагаемой модели, сравниваются с экспериментальными данными и данными, полученными с помощью модели воды TIP4P/2005. Сравнение показывает, что предлагаемая модель достаточно хорошо воспроизводит выбранные свойства. В статье также приводится вычислительная схема метода молекулярной динамики для NPT ансамбля. Предлагаемая модель не только воспроизводит основные свойства воды, но и требует значительно меньше вычислений по сравнению со стандартными многоточечными моделями воды. Данная модель предназначена для моделирования больших молекулярных систем, возникающих в различных задачах наногидродинамики.

Ключевые слова: модель воды, молекулярная динамика.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 15-19-10017
This research was funded by project 15-19-10017 of the Russian Science Foundation.


DOI: https://doi.org/10.17516/1997-1397-2015-8-4-487-496

Полный текст: PDF файл (756 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 544.272, 539.6, 532.74
Получена: 10.06.2015
Исправленный вариант: 24.08.2015
Принята: 01.10.2015
Язык публикации: английский

Образец цитирования: Viktor E. Zalizniak, “An efficient water model for large scale molecular dynamics simulations”, Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ., 8:4 (2015), 487–496

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Zal15}
\by Viktor~E.~Zalizniak
\paper An efficient water model for large scale molecular dynamics simulations
\jour Журн. СФУ. Сер. Матем. и физ.
\yr 2015
\vol 8
\issue 4
\pages 487--496
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/jsfu452}
\crossref{https://doi.org/10.17516/1997-1397-2015-8-4-487-496}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/jsfu452
  • http://mi.mathnet.ru/rus/jsfu/v8/i4/p487

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. V. E. Zalizniak, O. A. Zolotov, I. I. Ryzhkov, “Effective molecular dynamics model of ionic solutions for large-scale calculations”, J. Appl. Mech. Tech. Phys., 59:1 (2018), 41–51  crossref  mathscinet  isi  scopus
  • Журнал Сибирского федерального университета. Серия "Математика и физика"
    Просмотров:
    Эта страница:68
    Полный текст:17
    Литература:12

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019