RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2012, том 7, выпуск 2, страницы 493–507 (Mi mbb118)  

Математическое моделирование

Метод интегральных уравнений теории жидкостей в приближении RISM для исследования термодинамики самоорганизующихся ионных пептидов

Е. В. Соболевa, А. В. Данилковичbc, Д. А. Тихоновa

a Институт математических проблем биологии РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия
b Филиал института биоорганической химии им. академиков М. М. Шемякина и Ю. А. Овчинникова РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия
c ГОУ ВПО Пущинский Государственный Естественнонаучный Институт, Учебный Центр на базе ФИБХ РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: Для изучения термодинамических характеристик комплексов самоорганизующихся ионных пептидов была применена модификация метода RISM с использованием средней матрицы внутримолекулярных корреляционных функций. Данный подход эффективен при анализе, как свободной энергии, так и структуры сольватной области макромолекул, для которых существует большие выборки конфигурационных состояний. Для расчетов свободной энергии, наряду с приближенными формулами был использован метод численного термодинамического интегрирования. Сравнение результатов расчетов свободной энергии разными способами показало, что использование метода термодинамического интегрирования позволяет получить наиболее адекватные величины энергий взаимодействия пептидных наноструктур в составе протофиламента. Сделаны выводы о применимости различных способов вычисления величин свободной энергии для изучения ионных пептидов и их комплексов.

Ключевые слова: интегральные уравнения, теория жидкостей, RISM, средняя матрица, энергия Гиббса, самоорганизующиеся структуры, ионные пептиды.

Полный текст: PDF файл (899 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 577.3, 51-76
Материал поступил в редакцию 02.07.2012, опубликован 20.08.2012

Образец цитирования: Е. В. Соболев, А. В. Данилкович, Д. А. Тихонов, “Метод интегральных уравнений теории жидкостей в приближении RISM для исследования термодинамики самоорганизующихся ионных пептидов”, Матем. биология и биоинформ., 7:2 (2012), 493–507

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SobDanTik12}
\by Е.~В.~Соболев, А.~В.~Данилкович, Д.~А.~Тихонов
\paper Метод интегральных уравнений теории жидкостей в приближении RISM для исследования термодинамики самоорганизующихся ионных пептидов
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2012
\vol 7
\issue 2
\pages 493--507
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb118}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb118
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v7/i2/p493

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Просмотров:
    Эта страница:150
    Полный текст:42
    Литература:23
    Первая стр.:1

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019