RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2012, том 7, выпуск 2, страницы 554–566 (Mi mbb122)  

Интеллектуальный анализ данных

Настройка нелинейной модели данных экспериментов с экспрессионными ДНК-микрочипами

Е. А. Рябенкоab

a Факультет вычислительной математики и кибернетики, Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, Москва, 119991, Россия
b НТЦ Биоклиникум, Москва, 115088, Россия

Аннотация: Рассматривается нелинейная модель данных ДНК-микрочипов, в которой интенсивность флуоресценции проб описывается функцией Лэнгмюра. Разработан метод настройки параметров модели на основе общедоступных данных нескольких тысяч экспериментов, основанный на минимизации функции потерь из класса AB-дивергенций; для выбора оптимальных значений гиперпараметров проведены численные эксперименты. Полученная модель описывает интенсивности флуоресценции проб микрочипа точнее стандартной линейной, а полученные на её основе оценки экспрессии более устойчивы.

Ключевые слова: ДНК-микрочипы, суммаризация, модель Лэнгмюра, AB-дивергенция.

Полный текст: PDF файл (557 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл
Тип публикации: Статья
УДК: 519.254
Материал поступил в редакцию 02.10.2012, опубликован 25.10.2012

Образец цитирования: Е. А. Рябенко, “Настройка нелинейной модели данных экспериментов с экспрессионными ДНК-микрочипами”, Матем. биология и биоинформ., 7:2 (2012), 554–566

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Ria12}
\by Е.~А.~Рябенко
\paper Настройка нелинейной модели данных экспериментов с экспрессионными ДНК-микрочипами
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2012
\vol 7
\issue 2
\pages 554--566
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb122}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb122
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v7/i2/p554

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Просмотров:
    Эта страница:178
    Полный текст:55
    Литература:21
    Первая стр.:1
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2020