RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2012, том 7, выпуск 2, страницы 692–702 (Mi mbb129)  

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Математическое моделирование

Использование программы кристаллографического уточнения Refmac в процессе выявления альтернативных конформаций в биологических макромолекулах

О. В. Соболев, В. Ю. Лунин

Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: Изучение смещений центров атомов при кристаллографическом уточнении макромолекулярной структуры без стереохимических ограничений позволяет обнаруживать присутствие альтернативных конформаций фрагментов полипептидной цепи. Процедуры автоматического принятия решений о наличии или отсутствии альтернативной конформации для конкретного фрагмента опираются на статистический анализ смещений атомов, полученных при тестовом уточнении большого количества белковых структур. При этом распределения вероятностей смещений оказываются зависимыми от используемой программы уточнения. В данной работе описаны построение баз смещений атомов, их анализ и разработка автоматических процедур идентификации альтернативных конформаций при использовании для уточнения структуры одного из наиболее популярных инструментов — программы Refmac.

Ключевые слова: структура биологических макромолекул, кристаллографическое уточнение, альтернативные конформации.

Полный текст: PDF файл (758 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 548.737
Материал поступил в редакцию 18.12.2012, опубликован 25.12.2012

Образец цитирования: О. В. Соболев, В. Ю. Лунин, “Использование программы кристаллографического уточнения Refmac в процессе выявления альтернативных конформаций в биологических макромолекулах”, Матем. биология и биоинформ., 7:2 (2012), 692–702

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SobLun12}
\by О.~В.~Соболев, В.~Ю.~Лунин
\paper Использование программы кристаллографического уточнения Refmac в процессе выявления альтернативных конформаций в биологических макромолекулах
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2012
\vol 7
\issue 2
\pages 692--702
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb129}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb129
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v7/i2/p692

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. Sobolev O.V., “Detection of Alternative Conformations: Shift_Plot and Ac_Prediction Programs”, J. Appl. Crystallogr., 46:2 (2013), 554–559  crossref  isi  elib  scopus
  • Просмотров:
    Эта страница:156
    Полный текст:31
    Литература:26
    Первая стр.:1

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2018