RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2013, том 8, выпуск 2, страницы 398–406 (Mi mbb167)  

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Биоинформатика

Распознавание и анализ устойчивости структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в глобулярных белках

В. Р. Рудневa, А. Н. Панкратовab, Л. И. Куликоваa, Ф. Ф. Дедусba, Д. А. Тихоновa, А. В. Ефимовc

a Институт математических проблем биологии РАН, 142290, Пущино, ул. Институтская, д. 4
b Факультет ВМК МГУ имени М. В. Ломоносова, 119991 ГСП-1, Москва, Ленинские горы
c Институт белка РАН, 142290, Пущино, ул. Институтская, д. 4

Аннотация: Рассматривается задача распознавания структурных мотивов белков на примере $\alpha$-$\alpha$-уголков. Предложен комбинированный подход к решению задач анализа пространственной структуры белков на основе аналитического описания основной цепи белковой глобулы и спектрального метода распознавания повторов. Нами найдено 110 $\alpha$-$\alpha$-уголков в базе данных PDB, соответствующих заданному эталону. Методом молекулярной динамики показано, что $\alpha$-$\alpha$-уголки как автономные структуры устойчивы в водной среде.

Ключевые слова: распознавание образов, ортогональные полиномы, аналитическое описание, супервторичные структуры белков.

Полный текст: PDF файл (523 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 519
Материал поступил в редакцию 21.05.2013, опубликован 17.07.2013

Образец цитирования: В. Р. Руднев, А. Н. Панкратов, Л. И. Куликова, Ф. Ф. Дедус, Д. А. Тихонов, А. В. Ефимов, “Распознавание и анализ устойчивости структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в глобулярных белках”, Матем. биология и биоинформ., 8:2 (2013), 398–406

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{RudPanKul13}
\by В.~Р.~Руднев, А.~Н.~Панкратов, Л.~И.~Куликова, Ф.~Ф.~Дедус, Д.~А.~Тихонов, А.~В.~Ефимов
\paper Распознавание и анализ устойчивости структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в глобулярных белках
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2013
\vol 8
\issue 2
\pages 398--406
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb167}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb167
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v8/i2/p398

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. В. Р. Руднев, А. Н. Панкратов, Л. И. Куликова, Ф. Ф. Дедус, Д. А. Тихонов, А. В. Ефимов, “Конформационный анализ структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в вычислительном эксперименте молекулярной динамики”, Матем. биология и биоинформ., 9:2 (2014), 575–584  mathnet
    2. Д. А. Тихонов, Л. И. Куликова, А. В. Ефимов, “Статистический анализ внутренних расстояний спиральных пар в белковых молекулах”, Матем. биология и биоинформ., 11:2 (2016), 170–190  mathnet  crossref
  • Просмотров:
    Эта страница:119
    Полный текст:36
    Литература:23
    Первая стр.:1

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2018