RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 1, страницы 33–62 (Mi mbb171)  

Эта публикация цитируется в 3 научных статьях (всего в 3 статьях)

Комментарии

Спектрально-статистический подход к распознаванию скрытой профильной периодичности в последовательностях ДНК

В. А. Кутыркинa, М. Б. Чалейb

a Московский Государственный Технический Университет им. Н. А. Баумана, Москва, 107005, Россия
b Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: Ранее, авторы настоящей работы ввели понятие скрытой профильной периодичности в последовательностях ДНК. В журнале «Математическая биология и биоинформатика» за 2013 год авторами была опубликована статья, в которой был изложен метод распознавания такого типа скрытой периодичности. Этот метод основан на применении спектрально- статистического подхода (2С-подхода). В своей статье авторы показали эффективность разработанного ими метода и провели его сравнение с известными методами, в частности, с методом информационного разложения (ИР-методом). В ответ на публикацию этой статьи, в журнал был представлен комментарий, авторами которого являются разработчики ИР-метода. Комментарий посвящён критике метода распознавания скрытой профильной периодичности, основанного на 2С-подходе. Из этого комментария следует, что авторы критики либо невнимательно читали текст нашей статьи, либо не знакомы с некоторыми понятиями использованного в ней математического аппарата. Поэтому мы сочли необходимым более подробно изложить теоретические основы метода и обратить внимание на ключевые моменты его применения, которые не были поняты критиками 2С-подхода. В настоящей работе показано, что, в отличие от 2С-подхода, ИР-метод не является самодостаточным методом распознавания скрытой периодичности в последовательностях ДНК и может выдавать некорректные результаты.

Ключевые слова: скрытая периодичность, спектрально-статистический подход, скрытая профильная периодичность.

Полный текст: PDF файл (2242 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл
Тип публикации: Статья
УДК: 577.2:519.23
Материал поступил в редакцию 29.12.2013, опубликован 29.01.2014

Образец цитирования: В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Спектрально-статистический подход к распознаванию скрытой профильной периодичности в последовательностях ДНК”, Матем. биология и биоинформ., 9:1 (2014), 33–62

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{KutCha14}
\by В.~А.~Кутыркин, М.~Б.~Чалей
\paper Спектрально-статистический подход к распознаванию скрытой профильной периодичности в последовательностях ДНК
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2014
\vol 9
\issue 1
\pages 33--62
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb171}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb171
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i1/p33

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Структурно-статистические свойства кодирующих районов ДНК”, Матем. биология и биоинформ., 10:2 (2015), 387–397  mathnet  crossref
    2. В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Модель организации кодирования в прокариотических организмах”, Матем. биология и биоинформ., 11:1 (2016), 24–45  mathnet  crossref
    3. Ж. С. Тюлько, В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 343–353  mathnet  crossref
  • Просмотров:
    Эта страница:181
    Полный текст:57
    Литература:50
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019