RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 2, страницы 504–517 (Mi mbb185)  

Математическое моделирование

Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы

И. Р. Акбердинa, Н. В. Иванисенкоa, Ф. В. Казанцевa, Е. А. Ощепковаa, Н. А. Омельянчукa, Ю. Г. Матушкинba, Д. А. Афонниковba

a Институт цитологии и генетики Сибирского отделения РАН, Новосибирск, 630090, Россия
b Новосибирский национальный исследовательский государственный университет, Новосибирск, 630090, Россия

Аннотация: В работе представлены результаты анализа кинетической и стохастической моделей, описывающих динамику функционирования коровой генной сети поддержания плюрипотентности и дифференцировки эмбриональных стволовых клеток, с учетом последних экспериментальных данных о регуляции экспрессии Nanog. Анализ кинетической модели показал, что в динамике изменения концентрации как мРНК, так и белка Nanog потенциально может существовать осциллирующий режим функционирования, что может объяснять наблюдаемую в экспериментах гетерогенность экспрессии Nanog в популяции столовых клеток. Стохастический подход, в свою очередь, позволил выявить диапазон параметров, при котором в результате стохастических флуктуаций существует два возможных состояния системы: с высоким и низким уровнями экспрессии Oct4, Sox2 и Nanog. При этом возможен спонтанный переход из одного состояния в другое, что также может являться одним из механизмов гетерогенности экспрессии Nanog.

Ключевые слова: плюрипотентное состояние, дифференцировка, экспрессия гена, гетерогенность Nanog, математическое моделирование.

Полный текст: PDF файл (808 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 57.032:573.22
Материал поступил в редакцию 15.10.2014, опубликован 16.12.2014

Образец цитирования: И. Р. Акбердин, Н. В. Иванисенко, Ф. В. Казанцев, Е. А. Ощепкова, Н. А. Омельянчук, Ю. Г. Матушкин, Д. А. Афонников, “Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы”, Матем. биология и биоинформ., 9:2 (2014), 504–517

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{AkbIvaKaz14}
\by И.~Р.~Акбердин, Н.~В.~Иванисенко, Ф.~В.~Казанцев, Е.~А.~Ощепкова, Н.~А.~Омельянчук, Ю.~Г.~Матушкин, Д.~А.~Афонников
\paper Моделирование механизмов регуляции поддержания плюрипотентности эмбриональных стволовых клеток: кинетический и стохастический подходы
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2014
\vol 9
\issue 2
\pages 504--517
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb185}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb185
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i2/p504

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Просмотров:
    Эта страница:111
    Полный текст:44
    Литература:17

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2018