RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2014, том 9, выпуск 2, страницы 575–584 (Mi mbb204)  

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Математическое моделирование

Конформационный анализ структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в вычислительном эксперименте молекулярной динамики

В. Р. Рудневa, А. Н. Панкратовa, Л. И. Куликоваa, Ф. Ф. Дедусa, Д. А. Тихоновa, А. В. Ефимовb

a Институт математических проблем биологии РАН, 142290, Пущино, Московская область, ул. Институтская, д. 4
b Институт белка РАН, 142290, Пущино, ул. Институтская, д. 4

Аннотация: В настоящей работе рассматривается задача распознавания структурных мотивов белков типа $\alpha$-$\alpha$-уголков, решаемая с помощью аналитического описания основной цепи белковой глобулы и спектрального метода распознавания повторов. Описывается проведенная верификация найденных структур по конформационному шаблону, охарактеризованному предельными значениями углов на карте Рамачандрана. Методом молекулярной динамики показано, что $\alpha$-$\alpha$-уголки с короткой перетяжкой как автономные структуры устойчивы в водной среде.

Ключевые слова: распознавание образов, структурные мотивы белков, анализ конформаций белковых структур, карта Рамачандрана, молекулярная динамика.

Полный текст: PDF файл (467 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 519
Материал поступил в редакцию 09.12.2014, опубликован 23.12.2014

Образец цитирования: В. Р. Руднев, А. Н. Панкратов, Л. И. Куликова, Ф. Ф. Дедус, Д. А. Тихонов, А. В. Ефимов, “Конформационный анализ структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в вычислительном эксперименте молекулярной динамики”, Матем. биология и биоинформ., 9:2 (2014), 575–584

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{RudPanKul14}
\by В.~Р.~Руднев, А.~Н.~Панкратов, Л.~И.~Куликова, Ф.~Ф.~Дедус, Д.~А.~Тихонов, А.~В.~Ефимов
\paper Конформационный анализ структурных мотивов типа $\alpha$-$\alpha$-уголок в~вычислительном эксперименте молекулярной динамики
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2014
\vol 9
\issue 2
\pages 575--584
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb204}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb204
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v9/i2/p575

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. Е. В. Бражников, А. М. Каргатов, А. В. Ефимов, “Структура петлевых участков в $\beta-\alpha$- и $\alpha-\beta$-дугах abCd-единиц в глобулярных белках”, Матем. биология и биоинформ., 11:2 (2016), 159–169  mathnet  crossref
    2. Д. А. Тихонов, Л. И. Куликова, А. В. Ефимов, “Статистический анализ внутренних расстояний спиральных пар в белковых молекулах”, Матем. биология и биоинформ., 11:2 (2016), 170–190  mathnet  crossref
  • Просмотров:
    Эта страница:79
    Полный текст:23
    Литература:11

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2018