RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2015, том 10, выпуск 2, страницы 508–525 (Mi mbb241)  

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Математическое моделирование

Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. II. Зависимость точности решения от шага дискретизации экспериментальных данных

Н. Л. Лунинаa, Т. Е. Петроваa, А. Г. Уржумцевbc, В. Ю. Лунинa

a Институт математических проблем биологии, Российская академия наук, Пущино, Московская область, Россия
b Institut de Génétique et Biologie Moléculaire et Cellulaire, Илькирш, Франция
c Université de Lorraine, Вандевр-ле-Нанси, Франция

Аннотация: Совершенствование техники рентгеновского дифракционного эксперимента приводит в настоящее время к возможности регистрации рассеянных лучей не только для кристаллических образцов, но и для изолированных больших биологических частиц (вирусов, макромолекулярных комплексов и отдельных клеток). Эксперимент с изолированной частицей позволяет получить значения интенсивностей рассеянных лучей для непрерывного спектра векторов рассеяния. Такой эксперимент дает гораздо больше экспериментальной информации, нежели в случае рассеяния кристаллическим образцом, когда информация ограничена набором брэгговских рефлексов. При практическом исследовании исходная непрерывная картина дифракции дискретизируется — набор используемой далее экспериментальной информации ограничивается значениями, выбранными в узлах регулярной сетки в пространстве векторов рассеяния (в обратном кристаллографическом пространстве). Однако в данном случае сетка более не обусловлена экспериментальными ограничениями, такими как размер элементарной ячейки кристалла, а может быть выбрана по желанию исследователя. Шаг дискретизации определяет количество информации, вовлеченной в процесс решения фазовой проблемы, и трудоемкость необходимых вычислений. В данной работе исследуется влияние шага дискретизации на точность решения фазовой проблемы, получаемого при использовании предложенного ранее авторами метода, основанного на использовании связных бинарных масок исследуемого объекта. Показано, что ожидаемое повышение точности решения при уменьшении шага дискретизации продолжается и после пересечения предела Найквиста, определяемого как величина, обратная к удвоенному размеру изучаемой биологической частицы.

Ключевые слова: рентгеновская кристаллография, фазовая проблема, XFEL, рассеяние изолированной частицей.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 13-04-00118_а
Работа выполнена при поддержке гранта РФФИ № 13-04-00118.


DOI: https://doi.org/10.17537/2015.10.508

Полный текст: PDF файл (1120 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 577.3
Материал поступил в редакцию 24.11.2015, опубликован 03.12.2015

Образец цитирования: Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, А. Г. Уржумцев, В. Ю. Лунин, “Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. II. Зависимость точности решения от шага дискретизации экспериментальных данных”, Матем. биология и биоинформ., 10:2 (2015), 508–525

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{LunPetUrz15}
\by Н.~Л.~Лунина, Т.~Е.~Петрова, А.~Г.~Уржумцев, В.~Ю.~Лунин
\paper Использование связных масок в задаче восстановления изображения изолированной частицы по данным рентгеновского рассеяния. II. Зависимость точности решения от шага дискретизации экспериментальных данных
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2015
\vol 10
\issue 2
\pages 508--525
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb241}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2015.10.508}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb241
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v10/i2/p508

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
    Цикл статей Перевод статьи

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. V. Y. Lunin, N. L. Lunina, T. E. Petrova, M. W. Baumstark, A. G. Urzhumtsev, “Mask-based approach to phasing of single-particle diffraction data”, Acta Crystallogr. Sect. D-Struct. Biol., 72:1 (2016), 147–157  crossref  isi
    2. В. Ю. Лунин, Н. Л. Лунина, Т. Е. Петрова, “Биологическая кристаллография без кристаллов”, Матем. биология и биоинформ., 12:1 (2017), 55–72  mathnet  crossref
  • Просмотров:
    Эта страница:138
    Полный текст:19
    Литература:33
    Первая стр.:5
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2020