|
Матем. биология и биоинформ., 2017, том 12, выпуск 2, страницы 343–353
(Mi mbb298)
|
|
|
|
Биоинформатика
Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов
Ж. С. Тюлькоa, В. А. Кутыркинb, М. Б. Чалейc a ОмГМУ Минздрава России, Омск, 644099, Россия
b МГТУ им. Н.Э. Баумана, Москва, 107005, Россия
c ИМПБ РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия
Аннотация:
На основе спектрально-статистического подхода исследуются основные структурно-статистические свойства кодирующих районов из геномов флавивирусов. Анализируются как полноразмерные кодирующие районы полипротеинов, так и их отдельные структурные сегменты. Показано, что структурно-статистические свойства геномных последовательностей флавивирусов, в целом, аналогичны выявленным ранее свойствам 3-регулярности и скрытой триплетной профильности в кодирующих районах геномов прокариот и эукариот. С другой стороны, в отдельных, кодирующих белки, структурных сегментах из геномов флавивирусов полностью отсутствует двухуровневая организация кодирования, и в их значительной части проявляется свойство однородности последовательности. Такие особенности кодирующих районов флавивирусов объясняются простой структурой и высокой скоростью мутаций их геномов.
Ключевые слова:
геном флавивирусов, геном прокариот, геном эукариот, спектрально-статистический подход, скрытая профильная периодичность, свойство 3-регулярности.
DOI:
https://doi.org/10.17537/2017.12.343
Полный текст:
PDF файл (948 kB)
Список литературы:
PDF файл
HTML файл
Тип публикации:
Статья
УДК:
577.2:519.23 Материал поступил в редакцию 08.09.2017, опубликован 12.10.2017
Образец цитирования:
Ж. С. Тюлько, В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 343–353
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TyuKutCha17}
\by Ж.~С.~Тюлько, В.~А.~Кутыркин, М.~Б.~Чалей
\paper Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2017
\vol 12
\issue 2
\pages 343--353
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb298}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2017.12.343}
Образцы ссылок на эту страницу:
http://mi.mathnet.ru/mbb298 http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i2/p343
Citing articles on Google Scholar:
Russian citations,
English citations
Related articles on Google Scholar:
Russian articles,
English articles
|
Просмотров: |
Эта страница: | 37 | Полный текст: | 9 | Литература: | 4 |
|