Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS


Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти




Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация

Матем. биология и биоинформ., 2017, том 12, выпуск 2, страницы 343–353 (Mi mbb298)  
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Биоинформатика

Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов

Ж. С. Тюлькоa, В. А. Кутыркинb, М. Б. Чалейc

a ОмГМУ Минздрава России, Омск, 644099, Россия
b МГТУ им. Н.Э. Баумана, Москва, 107005, Россия
c ИМПБ РАН – филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Московская область, 142290, Россия

Аннотация: На основе спектрально-статистического подхода исследуются основные структурно-статистические свойства кодирующих районов из геномов флавивирусов. Анализируются как полноразмерные кодирующие районы полипротеинов, так и их отдельные структурные сегменты. Показано, что структурно-статистические свойства геномных последовательностей флавивирусов, в целом, аналогичны выявленным ранее свойствам 3-регулярности и скрытой триплетной профильности в кодирующих районах геномов прокариот и эукариот. С другой стороны, в отдельных, кодирующих белки, структурных сегментах из геномов флавивирусов полностью отсутствует двухуровневая организация кодирования, и в их значительной части проявляется свойство однородности последовательности. Такие особенности кодирующих районов флавивирусов объясняются простой структурой и высокой скоростью мутаций их геномов.

Ключевые слова: геном флавивирусов, геном прокариот, геном эукариот, спектрально-статистический подход, скрытая профильная периодичность, свойство 3-регулярности.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 15-07-05783_а
Работа была выполнена при частичной поддержке гранта РФФИ № 15-07-05783.


DOI: https://doi.org/10.17537/2017.12.343

Полный текст: PDF файл (948 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 577.2:519.23
Материал поступил в редакцию 08.09.2017, опубликован 12.10.2017

Образец цитирования: Ж. С. Тюлько, В. А. Кутыркин, М. Б. Чалей, “Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 343–353

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TyuKutCha17}
\by Ж.~С.~Тюлько, В.~А.~Кутыркин, М.~Б.~Чалей
\paper Структурно-статистические свойства геномов флавивирусов
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2017
\vol 12
\issue 2
\pages 343--353
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb298}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2017.12.343}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb298
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i2/p343

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. М. Б. Чалей, Ж. С. Тюлько, В. А. Кутыркин, “Распознавание видов флавивирусов на основе кодирующих последовательностей полипротеинов”, Матем. биология и биоинформ., 14:2 (2019), 533–542  mathnet  crossref
    • Просмотров:
    Эта страница:113
    Полный текст:26
    Литература:11
     
    Обратная связь:
    		  Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2021