RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2017, том 12, выпуск 2, страницы 411–434 (Mi mbb303)  

Интеллектуальный анализ данных

Сравнительный анализ подходов к классификации дифракционных изображений биологических частиц, получаемых в экспериментах по когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии

С. А. Бобков

Национальный исследовательский центр “Курчатовский Институт”, Москва, Россия

Аннотация: Метод когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии дает возможность определения трехмерной структуры наноразмерных объектов, в том числе таких биологических частиц, как белки и вирусы, с разрешением до 1 Å. В таких экспериментах излучение лазера на свободных электронах рассеивается на изучаемых объектах. На основе собранных дифракционных изображений можно определить исходную структуру объекта. Однако далеко не все дифракционные изображения, получаемые в экспериментах, подходят для восстановления структуры. Большинство изображений бывают пустыми, многие изображения относится к частицам примеси, другие содержат дифракционную картину от нескольких частиц. Таким образом, классификация изображений по типу структуры становится важным этапом первичной обработки данных. В работе сравниваются несколько подходов к классификации изображений по типу структуры. Сравнение проведено на разных наборах экспериментальных данных. В 2017 году начал работу новый лазер на свободных электронах European XFEL, который позволит регистрировать до 27000 дифракционных изображений в секунду. В статье представлены результаты исследования возможности применения разных подходов для классификации изображений в экспериментах на European XFEL в потоковом режиме.

Ключевые слова: когерентная рентгеновская дифракционная микроскопия, биологические частицы, корреляционные коэффициенты, метод опорных векторов, метод к-средних, метод спектральной кластеризации, многослойный перцептрон, свёрточная нейронная сеть.

Финансовая поддержка Номер гранта
Министерство образования и науки Российской Федерации RFMEFI61614X0003
Работа была выполнена при поддержке соглашения о предоставлении субсидии № 14.616.21.0003 (уникальный идентификатор научных исследований RFMEFI61614X0003).


DOI: https://doi.org/10.17537/2017.12.411

Полный текст: PDF файл (2343 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 004.02, 004.94
Материал поступил в редакцию 01.11.2017, опубликован 29.11.2017

Образец цитирования: С. А. Бобков, “Сравнительный анализ подходов к классификации дифракционных изображений биологических частиц, получаемых в экспериментах по когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии”, Матем. биология и биоинформ., 12:2 (2017), 411–434

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Bob17}
\by С.~А.~Бобков
\paper Сравнительный анализ подходов к классификации дифракционных изображений биологических частиц, получаемых в экспериментах по когерентной рентгеновской дифракционной микроскопии
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2017
\vol 12
\issue 2
\pages 411--434
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb303}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2017.12.411}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb303
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i2/p411

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Просмотров:
    Эта страница:60
    Полный текст:12
    Литература:4

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019