RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2017, том 12, выпуск Suppl., страницы t12–t22 (Mi mbb315)  

Переводы опубликованных статей

Integration of foreign genetic material provokes local mutagenesis in the recipient genome

[Интеграция чужеродного генетического материала провоцирует локальный мутагенез в геноме бактерии-реципиента]

O. A. Glazunovaa, K. S. Shavkunova, M. N. Tutukinaa, V. V. Panyukovb, O. N. Ozolinea

a 142290, Institute of Cell Biophysics of Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, Russian Federation
b 142290, Institute of Mathematical Problems of Biology – the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics of Russian Academy of Sciences, Pushchino, Moscow Region, Russian Federation

Аннотация: Обмен генетической информацией является одним из основных факторов бактериальной эволюции, но механизмы интеграции горизонтально перенесённых генов в регуляторные сети нового хозяина остаются практически не исследованными. Данная работа посвящена изучению этого адаптационного процесса, в том числе, участия в нём транскрипционного аппарата бактериальных клеток. Для этого два чужих гена в геноме Escherichia coli K12 MG1655 были заменены на новые копии из геномов предполагаемых доноров и начат хронический рост мутантных и контрольных культур. Через 2000 (для гена sfmA) и 4000 (для гена ydhZ) генераций было проведено популяционное секвенирование ампликонов модифицированных и исходных участков генома, с последующим анализом обнаруженных в них спонтанных мутаций. Установлено, что в модифицированных участках чаще, чем в немодифицированных, возникают замены G/C-пар на A/T-пары, а замены A/T $\to$ G/C, наоборот, наблюдаются реже. Это значит, что в ответ на введение чужеродного генетического материала в геноме возникает адаптивная реакция, направленная на обогащение модифицированного участка A/T-парами. В процессе длительной эволюции это может привести как к «замалчиванию» нежелательного гена с участием специфического супрессора чужеродных генов H-NS, так и к созданию приемлемого для адекватной экспрессии промотора в составе промоторного островка.

Ключевые слова: бактериальная эволюция, горизонтальный перенос генов, однонуклеотидный полиморфизм, промоторные островки.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 14-14-00985
Российский фонд фундаментальных исследований 16-04-01570_а
The expression analysis and creation of Matcher and MisMatcher were carried out with the financial support from the Russian Science Foundation (grant 14-14-00985, http://rscf.ru/node/8, ONO (PI), OAG, MNT, KSS). The search for model genes and obtainment of mutants were carried out with the financial support of the Russian Foundation for Basic Research (grant 16-04-01570, ONO (PI), OAG).


DOI: https://doi.org/10.17537/2017.12.t12

Полный текст: PDF файл (505 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 577.218:579.253.43
Материал поступил в редакцию 22.02.2017, опубликован 06.03.2017
Язык публикации: английский

Образец цитирования: O. A. Glazunova, K. S. Shavkunov, M. N. Tutukina, V. V. Panyukov, O. N. Ozoline, “Integration of foreign genetic material provokes local mutagenesis in the recipient genome”, Матем. биология и биоинформ., 12, Suppl. (2017), t12–t22

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{GlaShaTut17}
\by O.~A.~Glazunova, K.~S.~Shavkunov, M.~N.~Tutukina, V.~V.~Panyukov, O.~N.~Ozoline
\paper Integration of foreign genetic material provokes local mutagenesis in the recipient genome
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2017
\vol 12
\pages t12--t22
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb315}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2017.12.t12}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb315
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v12/i3/p12

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
    Перевод статьи
  • Просмотров:
    Эта страница:22
    Полный текст:7
    Литература:8

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2018