Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2018, том 13, выпуск 2, страницы 534–550 (Mi mbb354)  

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Математическое моделирование

Особенности движения заряда в однородных молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины. Быстрое формирование движущегося поляронного состояния

А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно

Институт математических проблем биологии РАН – филиал Федерального государственного учреждения ”Федеральный исследовательский центр Институт прикладной математики им. М.В. Келдыша Российской академии наук”, Пущино, Московская область, Россия

Аннотация: На основе нелинейной модели динамической структуры ДНК Пейрарда–Бишопа–Доксуа–Холстейна проведены численные эксперименты, демонстрирующие возможность переноса заряда в однородных незамкнутых G/C цепочках ДНК при отсутствии электрического поля в цепочке. Считается, что основным носителем тока в однородных синтетических полинуклеотидных последовательностях является полярон. Ранее нами были рассмотрены особенности движения полярона в молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины. Было показано, что полярон, помещённый в начальный момент времени не в центр цепочки, приобретает способность двигаться при отсутствии электрического поля и дополнительных возбуждений в цепочке. Были проведены численные эксперименты, демонстрирующие возможность переноса заряда поляронами в однородной незамкнутой G/C цепочке ДНК за счёт взаимодействия с локализованными возбуждениями. В данном исследовании в начальный момент времени в цепочку вносится не полярон, а заряд локализованный в области определённого числа соседних сайтов, смещённых из положений равновесия. Движение заряда в цепочке обусловлено выбором указанных начальных условий, которые обеспечивают быстрое формирование поляронного состояния и, как следствие, перемещение заряда по цепочке. Для задания внешних нелинейных возбуждений использовались ненулевые значения смещений частиц и/или их скоростей в начальный момент времени. Ненулевые значения скоростей сайтов цепочки в начальный момент времени использовались для стимуляции движения заряда. Показано, что для быстрого формирования поляронного состояния, задаваемые начальные условия должны соответствовать параметрам полярона, который образуется в цепочке при выбранных параметрах. Показано также, что, в зависимости от параметров цепочки и от параметров выбранных начальных условий, заряд может переноситься на большие расстояния.

Ключевые слова: нанобиоэлектроника, молекулярные провода, молекулярные цепочки, поляроны, ДНК, перенос заряда, модель Пейрарда–Бишопа–Доксуа–Холстейна.

DOI: https://doi.org/10.17537/2018.13.534

Полный текст: PDF файл (1164 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 519.6, 51-7
Материал поступил в редакцию 07.12.2018, опубликован 25.12.2018

Образец цитирования: А. Н. Коршунова, В. Д. Лахно, “Особенности движения заряда в однородных молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины. Быстрое формирование движущегося поляронного состояния”, Матем. биология и биоинформ., 13:2 (2018), 534–550

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{KorLak18}
\by А.~Н.~Коршунова, В.~Д.~Лахно
\paper Особенности движения заряда в однородных молекулярных полинуклеотидных цепочках конечной длины. Быстрое формирование движущегося поляронного состояния
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2018
\vol 13
\issue 2
\pages 534--550
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb354}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2018.13.534}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb354
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v13/i2/p534

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. Korshunova A.N., Lakhno V.D., “Charge Transfer By Polarons in a Homogeneouspoly G/Poly C-Chain Subjected to a Constant Electric Field in Terms of the Peyrard-Bishop-Holstein Model”, Tech. Phys., 65:9 (2020), 1467–1474  crossref  isi  scopus
  • Просмотров:
    Эта страница:91
    Полный текст:24
    Литература:2
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2021