Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2018, том 13, выпуск 2, страницы 563–590 (Mi mbb356)  

Информационные и вычислительные технологии в биологии и медицине

Метод оптимальных разбиений для оценки влияния степени оксигенации гемоглобина на фактор роста эндотелия сосудов

О. В. Сенькоa, М. С. Кодрянb, А. В. Кузнецоваc, Л. Л. Клименкоd, А. И. Деевd, И. С. Баскаковd, А. Н. Мазилинаe

a Федеральный исследовательский центр «Информатика и управление» Российской академии наук, Москва, Россия
b Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Москва, Россия
c Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля, Москва, Россия
d Институт химической физики им. Н.Н. Семенова, Москва, Россия
e Отделение неврологии КБ № 123 ФМБА России

Аннотация: Целью работы является исследование связи фактора роста эндотелия сосудов в сыворотке крови и гипоксией в группах пациентов, страдающих тяжелыми неврологическими заболеваниями. Имеющиеся в литературе данные свидетельствуют об активации синтеза этого белка при гипоксии. Вместе с тем, стандартный корреляционный анализ не позволил достоверно выявить по клиническим данным наличие связи между уровнем фактора роста эндотелия сосудов и параметрами оксиметрии, объективно характеризующими снабжение организма кислородом. В статье представлена методика, позволившая статистически достоверно доказать существование указанной связи, сводящейся к увеличении корреляции между VEGF и комплементом C4, а также между VEGF и белками S100 при снижении уровня оксигенации ниже некоторого порогового значения. Методика включает поиск таких границ для показателей оксиметрии, при которых достигаются максимальные различия по уровню корреляции между VEGF и некоторым дополнительным фактором Z в образуемых группах, а также по возможности максимальный уровень корреляции между VEGF и Z в одной из групп. Использовалась оригинальная методика статистической верификации, основанная на использовании перестановочных тестов, которая позволила не только установить статистическую достоверность эффектов, связанных с отдельными показателями оксиметрии, но и рассчитать совокупную значимость по всем таким показателям. В связи с исследованием возможности использования в качестве дополнительных факторов Z большого числа показателей, потребовалась коррекция с целью учета множественного тестирования.

Ключевые слова: фактор роста эндотелия сосудов, гипоксия, верификация, перестановочный тест, множественное тестирование.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 18-01-00557_а
17-07-01362_а
Работа выполнена при частичной финансовой поддержке РФФИ, проекты 17-07-01362, 18-01-00557.


DOI: https://doi.org/10.17537/2018.13.563

Полный текст: PDF файл (589 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 004.852
Материал поступил в редакцию 28.08.2018, опубликован 27.12.2018

Образец цитирования: О. В. Сенько, М. С. Кодрян, А. В. Кузнецова, Л. Л. Клименко, А. И. Деев, И. С. Баскаков, А. Н. Мазилина, “Метод оптимальных разбиений для оценки влияния степени оксигенации гемоглобина на фактор роста эндотелия сосудов”, Матем. биология и биоинформ., 13:2 (2018), 563–590

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SenKodKuz18}
\by О.~В.~Сенько, М.~С.~Кодрян, А.~В.~Кузнецова, Л.~Л.~Клименко, А.~И.~Деев, И.~С.~Баскаков, А.~Н.~Мазилина
\paper Метод оптимальных разбиений для оценки влияния степени оксигенации гемоглобина на фактор роста эндотелия сосудов
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2018
\vol 13
\issue 2
\pages 563--590
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb356}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2018.13.563}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb356
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v13/i2/p563

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Просмотров:
    Эта страница:132
    Полный текст:67
    Литература:5
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2022