RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2018, том 13, выпуск Suppl., страницы t1–t16 (Mi mbb359)  

Переводы опубликованных статей

Big Data in bioinformatics

[Большие данные в биоинформатике]

N. N. Nazipovaa, E. A. Isaevb, V. V. Kornilovb, D. V. Pervukhinb, A. A. Morozovac, A. A. Gorbunovb, M. N. Ustinina

a Institute of Mathematical Problems of Biology RAS - the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics of Russian Academy of Sciences
b National Research University "Higher School of Economics"
c The Union of Enterprises the Central Scientific and Production Association "CASCADE"

Аннотация: Секвенирование человеческого генома началось в 1994 году. Понадобилось 10 лет работы многих научных коллективов для того, чтобы получить черновую последовательность ДНК человека. Современные технологии секвенирования позволяют получать геном конкретного человека за несколько дней. Обсуждаются успехи современной биоинформатики, связанные с появлением высокопроизводительных платформ секвенирования, которые не только способствовали расширению возможностей различных направлений биологии и других смежных наук, но и породили феномен больших данных. Обосновывается необходимость разработки новых технологий и методов для организации хранения, управления, анализа и визуализации больших данных. Современная биоинформатика столкнулась не только с проблемой больших данных, но и с огромным разнообразием методов обработки и представления, одновременным существованием различных программных средств и форматов данных. Обсуждаются пути решения возникших проблем, в частности путем использования наработок работы с большими данными из других областей современной жизни, таких как сетевой анализ и анализ деловых данных. Новые системы управления базами данных, отличные от реляционных, помогут решить проблему хранения больших данных и обеспечения приемлемого времени выполнения поисковых запросов. Новые технологии программирования, такие, как обобщенное программирование и визуальное программирование призваны решить проблему разнообразия форматов геномных данных и обеспечить возможность оперативного создания собственных скриптов для обработки данных.

Ключевые слова: большие данные, Big Data, NGS, секвенирование генома, IT-технологии, биоинформатика, обобщенное программирование, визуальное программирование, нереляционные системы управления базами данных, NoSQL системы, Hadoop, MapReduce.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 15-07-05783_а
16-07-00937_а
16-07-01000_а
Российская академия наук - Федеральное агентство научных организаций I.33P
The study was partially supported by RFBR grants 15-07-05783 (N.N.N), 16-07-00937 and 16-07-01000 (U.M.N) and the Program of Fundamental Scientific Research of the Presidium of the Russian Academy of Sciences I.33P. (U.M.N).


DOI: https://doi.org/10.17537/2018.13.t1

Полный текст: PDF файл (301 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 004.9:004.9:004.8:577.21
Материал поступил в редакцию 16.03.2018, опубликован 03.04.2018
Язык публикации: английский

Образец цитирования: N. N. Nazipova, E. A. Isaev, V. V. Kornilov, D. V. Pervukhin, A. A. Morozova, A. A. Gorbunov, M. N. Ustinin, “Big Data in bioinformatics”, Матем. биология и биоинформ., 13, Suppl. (2018), t1–t16

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{NazIsaKor18}
\by N.~N.~Nazipova, E.~A.~Isaev, V.~V.~Kornilov, D.~V.~Pervukhin, A.~A.~Morozova, A.~A.~Gorbunov, M.~N.~Ustinin
\paper Big Data in bioinformatics
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2018
\vol 13
\pages t1--t16
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb359}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2018.13.t1}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb359
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v13/i3/p1

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
    Перевод статьи
    • Большие данные в биоинформатике
      Н. Н. Назипова, Е. А. Исаев, В. В. Корнилов, Д. В. Первухин, А. А. Морозова, А. А. Горбунов, М. Н. Устинин
      Матем. биология и биоинформ., 2017, 12:1, 102–119
  • Просмотров:
    Эта страница:176
    Полный текст:58
    Литература:14
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2021