RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2018, том 13, выпуск Suppl., страницы t17–t28 (Mi mbb360)  

Переводы опубликованных статей

Analysis of torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules

[Анализ торсионных углов между осями спиралей в спиральных парах белковых молекул]

D. A. Tikhonova, L. I. Kulikovaa, A. V. Efimovb

a Institute of Mathematical Problems of Biology RAS – the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia
b Institute of Protein Research, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia

Аннотация: В данной работе проведен анализ распределения торсионных углов между осями спиралей в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Исследование проводилось на множестве спиральных пар, отобранных из структур белковых молекул, представленных в PDB. Полученное множество спиральных пар было проанализировано и разбито на три подмножества по критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей. Показано, что распределение всех типов спиральных пар, не имеющих пересечений проекций спиралей, в зависимости от торсионного угла охватывает практически весь диапазон углов с двумя пиками в области $0^\circ$ и $180^\circ$. Большинство пар указанного подмножества составляют спиральные пары, состоящие из $\alpha$- и $3_{10}$-спиралей. Спиральные пары, образованные двумя $\alpha$-спиралями, представляют значительную часть подмножества с пересечением проекций спиралей, и распределение таких структур имеет максимум в области значений торсионного угла между осями спиралей в области $20^\circ$$25^\circ$. Образованные двумя $\alpha$-спиралями спиральные пары составляют абсолютное большинство пар подмножества с пересечением проекций и осей спиралей. Для них характерно распределение с тремя максимумами, лежащими в области острых углов: в области отрицательных значений (от $-50^\circ$ до $-25^\circ$), в области положительных значений углов (от $20^\circ$ до $25^\circ$) и в области прямого угла (от $70^\circ$ до $110^\circ$).

Ключевые слова: структурные мотивы, точечная модель, спиральные пары в белковых молекулах, торсионный угол между осями спиралей.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 16-01-00692_а
18-07-01031_а
The study was supported by the RFBR (projects № 16-01-00692 and № 18-07-01031).


DOI: https://doi.org/10.17537/2018.13.t17

Полный текст: PDF файл (928 kB)

Тип публикации: Статья
УДК: 519-7, 51-76
Материал поступил в редакцию 24.04.2018, опубликован 30.04.2018
Язык публикации: английский

Образец цитирования: D. A. Tikhonov, L. I. Kulikova, A. V. Efimov, “Analysis of torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules”, Матем. биология и биоинформ., 13, Suppl. (2018), t17–t28

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TikKulEfi18}
\by D.~A.~Tikhonov, L.~I.~Kulikova, A.~V.~Efimov
\paper Analysis of torsion angles between helical axes in pairs of helices in protein molecules
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2018
\vol 13
\pages t17--t28
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb360}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2018.13.t17}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb360
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v13/i3/p17

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
    Перевод статьи
  • Просмотров:
    Эта страница:9
    Полный текст:4

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019