Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2019, том 14, выпуск Suppl., страницы t1–t17 (Mi mbb413)  

Переводы опубликованных статей

The study of interhelical angles in the structural motifs formed by two helices

[Исследование межспиральных углов в структурных мотивах, образованных двумя спиралями]

D. A. Tikhonova, L. I. Kulikovaa, A. V. Efimovb

a Institute of Mathematical Problems of Biology RAS – the Branch of Keldysh Institute of Applied Mathematics of Russian Academy of Sciences
b Institute of Protein Research, Russian Academy of Sciences, Pushchino, Russia

Аннотация: В данной работе проведен анализ распределения межспиральных углов в парах связанных между собой перетяжками спиралей в пространственных структурах белковых молекул. Были разработаны правила отбора спиральных пар в структурах белковых молекул из Protein Data Bank. Полученное множество спиральных пар было проанализировано с целью его классификации и установления закономерностей структурной организации. По критерию пересечения проекций спиралей на параллельные плоскости, проходящие через оси спиралей, полученное множество было разбито на три подмножества. Показано, что распределение всех типов спиральных пар, не имеющих пересечения проекций спиралей, охватывает практически весь диапазон углов с одним максимумом в области прямого угла. Большинство пар этого множества составляют спиральные пары, состоящие из $\alpha$- и $3_{10}$-спиралей, а множества с пересечением только проекций спиралей – спиральные пары, образованные двумя $\alpha$-спиралями. Также показано, что образованные двумя $\alpha$-спиралями спиральные пары составляют абсолютное большинство пар множества с пересечением проекций и осей спиралей. При этом значительная часть указанных пар имеет острый угол ($20^\circ \leqslant\varphi \leqslant 60^\circ$) между осями спиралей. Проведен анализ распределения всех типов спиральных пар, принадлежащих различным множествам, в зависимости от длины перетяжки. Показано, что во всех множествах больше всего исследуемых структур с короткой перетяжкой.

Ключевые слова: структурные мотивы белков, точечная модель, спиральные пары в белковых молекулах, угол между осями спиралей.

Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 18-07-01031


DOI: https://doi.org/10.17537/2019.14.t1

Полный текст: PDF файл (1307 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 519
Материал поступил в редакцию 29.01.2019, опубликован 08.02.2019
Язык публикации: английский

Образец цитирования: D. A. Tikhonov, L. I. Kulikova, A. V. Efimov, “The study of interhelical angles in the structural motifs formed by two helices”, Матем. биология и биоинформ., 14, Suppl. (2019), t1–t17

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TikKulEfi19}
\by D.~A.~Tikhonov, L.~I.~Kulikova, A.~V.~Efimov
\paper The study of interhelical angles in the structural motifs formed by two helices
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2019
\vol 14
\pages t1--t17
\issueinfo Suppl.
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb413}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2019.14.t1}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb413
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v14/i3/p1

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
    Перевод статьи
  • Просмотров:
    Эта страница:10
    Полный текст:8
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2022