RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. биология и биоинформ., 2011, том 6, выпуск 2, страницы 161–172 (Mi mbb72)  

Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)

Биоинформатика

Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа: $\beta$-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1

И. В. Анищенкоa, А. В. Тузиковa, А. М. Андриановb

a Объединенный институт проблем информатики, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220012, Республика Беларусь
b Институт биоорганической химии, Национальная академия наук Беларуси, Минск, 220141, Республика Беларусь

Аннотация: На основе анализа межмолекулярных взаимодействий гликосфинголипида $\beta$-галактозилцерамида с центральной областью петли V3 ВИЧ-1 осуществлен компьютерный дизайн его двух водорастворимых аналогов — потенциальных ингибиторов репликации вируса. В результате показано, что ключевую роль в формировании структурных комплексов гликолипидов с петлей V3 ВИЧ-1 играют взаимодействия перекрывающихся $\pi$-орбиталей боковой цепи консервативного фенилаланина ее иммунногенной «верхушки» Gly-Pro-Gly-Gln/Arg-Ala-Phe с XH (X=C или O) группами остатка сахара. При этом существенный вклад в стабилизацию комплексов вносят водородные связи гидроксильных групп пиранозного кольца галактозы с полярными атомами основной цепи петли V3. Путем расчета величин энергии связывания сконструированных аналогов $\beta$-галактозилцерамида с пептидами петли V3 предсказана высокая вероятность проявления ими противовирусной активности.

Ключевые слова: ВИЧ-1, белок gp120, петля V3, $\beta$-галактозилцерамид, трехмерная структура, компьютерное моделирование, лекарственные препараты.

Полный текст: PDF файл (538 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Тип публикации: Статья
УДК: 577.322.5:543.25
Материал поступил в редакцию 31.05.2011, опубликован 22.07.2011

Образец цитирования: И. В. Анищенко, А. В. Тузиков, А. М. Андрианов, “Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа: $\beta$-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1”, Матем. биология и биоинформ., 6:2 (2011), 161–172

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{AniTuzAnd11}
\by И.~В.~Анищенко, А.~В.~Тузиков, А.~М.~Андрианов
\paper Компьютерный дизайн потенциальных лекарственных препаратов для терапии СПИДа:
$\beta$-галактозилцерамид и петля V3 белка gp120 ВИЧ-1
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2011
\vol 6
\issue 2
\pages 161--172
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb72}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mbb72
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mbb/v6/i2/p161

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. А. М. Андрианов, Ю. В. Корноушенко, И. А. Кашин, А. В. Тузиков, “Компьютерное конструирование новых ингибиторов проникновения ВИЧ-1 на основе гликосфинголипидов”, Матем. биология и биоинформ., 8:1 (2013), 258–275  mathnet
  • Просмотров:
    Эта страница:131
    Полный текст:42
    Литература:16
    Первая стр.:1

     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2018