RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор
Правила для авторов

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. моделирование, 2007, том 19, номер 3, страницы 59–73 (Mi mm936)  

Оптимизационная модель апоптоза: определение кинетических констант

А. В. Синцовa, М. В. Якобовскийb, С. Г. Кауфманнc, М. А. Ханинa

a Центр теоретических проблем физико-химической фармакологии РАН, Лаборатория математического моделирования физиологических процессов
b Институт математического моделирования РАН
c Division of Oncology Research, Mayo Clinic

Аннотация: Апоптозом называют особый механизм уничтожения опасных для организма клеток, который обусловлен действием внутриклеточной системы белков (прокаспаз и др.) Эти белки в норме находятся в пассивном состоянии и не влияют на жизненные процессы в клетке. Однако, после индукции апоптоза прокаспазы активируются (превращаются в каспазы) и разрушают белки, входящие в состав клетки. Апоптоз вызывают различные стимулы, к которым относятся молекулы, активирующие специальные мембранные “рецепторы смерти”, белок, называемый гранзимом $B$, проникающий в клетку через мембрану, и др. Гранзим $B$ не только активирует каспазы, но и обладает способностью непосредственно, без участия каспаз, разрушать внутриклеточные белки (апоптотические мишени). Основная цель работы заключается в исследовании методом математического моделирования динамики активации каспаз и разрушения мишеней апоптоза, при индукции этого процесса гранзимом $B$. В частности, исследовано влияние концентрации гранзима $B$ на динамику активации каспаз. Наибольшие трудности, возникшие при решении сформулированной задачи, связаны с отсутствием полного набора количественных данных, определяющих кинетические константы биохимических реакций, участвующих в системе апоптоза. Поэтому был предложен оптимизационный метод определения величин кинетических констант биохимических реакций, участвующих в апоптозе. Основу метода составляет поиск условного минимума потребления белков системой апоптоза. В результате применения этого метода была определена совокупность кинетических констант апоптоза, индуцированного гранзимом $B$. Были установлены следующие особенности динамики апоптоза: увеличение продолжительности лаг фазы при снижении концентрации гранзима $B$, слабая зависимость максимальной концентрации каспаз от концентрации гранзима $B$. Результаты моделирования приводят к новому взгляду на динамику активации каспаз и разрушения мишеней, а также позволяют исследовать возможность применения гранзима $B$ при лечении опухолей.

Полный текст: PDF файл (487 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Реферативные базы данных:
Поступила в редакцию: 02.02.2006

Образец цитирования: А. В. Синцов, М. В. Якобовский, С. Г. Кауфманн, М. А. Ханин, “Оптимизационная модель апоптоза: определение кинетических констант”, Матем. моделирование, 19:3 (2007), 59–73

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SinIakKau07}
\by А.~В.~Синцов, М.~В.~Якобовский, С.~Г.~Кауфманн, М.~А.~Ханин
\paper Оптимизационная модель апоптоза: определение кинетических констант
\jour Матем. моделирование
\yr 2007
\vol 19
\issue 3
\pages 59--73
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mm936}
\zmath{https://zbmath.org/?q=an:1119.92333}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mm936
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mm/v19/i3/p59

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Математическое моделирование
    Просмотров:
    Эта страница:662
    Полный текст:156
    Литература:44
    Первая стр.:12
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019