RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор
Правила для авторов

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. моделирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Матем. моделирование, 2007, том 19, номер 4, страницы 62–70 (Mi mm948)  

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Параллельно-векторный алгоритм молекулярной динамики

Е. М. Пестряев

Уфимский государственный нефтяной технический университет

Аннотация: Рассмотрен способ увеличения производительности программ молекулярной динамики путем полного использования аппаратных ресурсов современных процессоров на примере Pentium 4 Hyper Threading и Athlon 64 Х2. Первый виден операционной системе как два виртуальных процессора, а второй имеет два реальных процессора на одной микросхеме. В обоих случаях как пара виртуальных, так и пара реальных процессоров имеет общую память и аппаратную надстройку в виде мультимедийных SSE-регистров – векторных регистров. Благодаря этому расчет может быть распараллелен вначале на два процессора, а затем векторизован в SSE-регистрах каждого из них еще в четыре потока. В итоге количество одновременно выполняемых шагов исходного алгоритма становится равным восьми, что до недавнего времени требовало компьютерного кластера со специальным программным обеспечением. Приведен текст параллельно-векторного алгоритма на Си++ и исследована его сравнительная производительность в зависимости от числа потоков на обоих типах процессоров.

Полный текст: PDF файл (175 kB)
Список литературы: PDF файл   HTML файл

Реферативные базы данных:
Поступила в редакцию: 20.03.2006

Образец цитирования: Е. М. Пестряев, “Параллельно-векторный алгоритм молекулярной динамики”, Матем. моделирование, 19:4 (2007), 62–70

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Pes07}
\by Е.~М.~Пестряев
\paper Параллельно-векторный алгоритм молекулярной динамики
\jour Матем. моделирование
\yr 2007
\vol 19
\issue 4
\pages 62--70
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mm948}
\zmath{https://zbmath.org/?q=an:1119.92368}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/mm948
  • http://mi.mathnet.ru/rus/mm/v19/i4/p62

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles

    Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
    1. Pestryaev E.M., “Molecular-Dynamics Study of Chain Reptation in a Gel”, Polym. Sci. Ser. A, 55:5 (2013), 336–352  crossref  isi  elib  scopus
    2. Е. М. Пестряев, “Тестирование многоядерных графических процессоров на алгоритме молекулярной динамики”, Матем. моделирование, 26:1 (2014), 69–82  mathnet
  • Математическое моделирование
    Просмотров:
    Эта страница:388
    Полный текст:117
    Литература:35
    Первая стр.:9
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2019