|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Теория кодирования
ДНК-коды для неаддитивного стебельного сходства
А. Г. Дьячковa, А. Н. Кузинаa, Н. А. Полянскийa, А. Макулаb, В. В. Рыковc a Московский государственный университет им. М. В. Ломоносова, механико-математический факультет, кафедра теории вероятностей
b Университет штата Нью-Йорк в Дженезео, математическое
отделение
c Небрасский университет в Омахе
Аннотация:
ДНК-последовательностями называются последовательности с элементами из четверичного ДНК-алфавита $\{A,C,G,T\}$, существенной особенностью которых является их направленность и способность образовывать дуплексы в результате процесса гибридизации – сращивания двух противоположно направленных последовательностей. В биологических экспериментах, использующих это свойство, необходимым является создание ансамблей таких последовательностей (ДНК-кодов), которые состоят из пар ДНК-последовательностей, называемых дуплексами Ватсона–Крика. Кроме того, энергия гибридизации – мера устойчивости потенциального ДНК-дуплекса – для любых двух слов ДНК-кода, не образующих дуплекс Ватсона–Крика, ограничена сверху некоторым числом, определяемым условиями эксперимента. Такая задача может быть естественным образом интерпретирована в терминах теории кодирования. В продолжение предыдущих работ рассматривается неаддитивная функция сходства двух ДНК-последовательностей, позволяющая наиболее адекватно моделировать энергию их гибридизации. Для максимального объема ДНК-кодов, основанных на таком сходстве, устанавливается верхняя граница Синглтона и приводится пример оптимальной конструкции. С помощью ансамблей ДНК-кодов со специальными ограничениями на кодовые слова (ансамблей Фибоначчи) получена нижняя граница случайного кодирования на максимальный объем ДНК-кодов при указанном сходстве.
Полный текст:
PDF файл (422 kB)
Список литературы:
PDF файл
HTML файл
Англоязычная версия:
Problems of Information Transmission, 2014, 50:3, 247–269
Реферативные базы данных:
Тип публикации:
Статья
УДК:
621.391.15 Поступила в редакцию: 24.06.2013 После переработки: 16.12.2013
Образец цитирования:
А. Г. Дьячков, А. Н. Кузина, Н. А. Полянский, А. Макула, В. В. Рыков, “ДНК-коды для неаддитивного стебельного сходства”, Пробл. передачи информ., 50:3 (2014), 51–75; Problems Inform. Transmission, 50:3 (2014), 247–269
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{DyaKuzPol14}
\by А.~Г.~Дьячков, А.~Н.~Кузина, Н.~А.~Полянский, А.~Макула, В.~В.~Рыков
\paper ДНК-коды для неаддитивного стебельного сходства
\jour Пробл. передачи информ.
\yr 2014
\vol 50
\issue 3
\pages 51--75
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/ppi2144}
\transl
\jour Problems Inform. Transmission
\yr 2014
\vol 50
\issue 3
\pages 247--269
\crossref{https://doi.org/10.1134/S0032946014030041}
\isi{http://gateway.isiknowledge.com/gateway/Gateway.cgi?GWVersion=2&SrcApp=PARTNER_APP&SrcAuth=LinksAMR&DestLinkType=FullRecord&DestApp=ALL_WOS&KeyUT=000343931900004}
\scopus{https://www.scopus.com/record/display.url?origin=inward&eid=2-s2.0-84910006769}
Образцы ссылок на эту страницу:
http://mi.mathnet.ru/ppi2144 http://mi.mathnet.ru/rus/ppi/v50/i3/p51
Citing articles on Google Scholar:
Russian citations,
English citations
Related articles on Google Scholar:
Russian articles,
English articles
Эта публикация цитируется в следующих статьяx:
-
H. Hong, L. Wang, H. Ahmad, J. Li, Y. Yang, Ch. Wu, “Construction of Dna Codes By Using Algebraic Number Theory”, Finite Fields their Appl., 37 (2016), 328–343
|
Просмотров: |
Эта страница: | 203 | Полный текст: | 53 | Литература: | 35 | Первая стр.: | 25 |
|