Вычислительные методы и программирование
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Выч. мет. программирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Выч. мет. программирование, 2011, том 12, выпуск 1, страницы 9–23 (Mi vmp216)  

Программирование

Реализация поддержки параллельных вычислений в программах докинга SOLGRID и SOL

И. В. Офёркин, А. В. Сулимов, О. А. Кондакова, В. Б. Сулимов

Научно-исследовательский вычислительный центр, Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, 119991, ООО ``Димонта''

Аннотация: Рассмотрены схемы реализации и получившиеся эффективности для нескольких вариантов докинга одного лиганда с использованием параллельных вычислений. В качестве программ, для которых реализовывались параллельные версии, были выбраны программы SOLGRID и SOL. Тестирование проводилось на кластерном суперкомпьютере СКИФ МГУ “Чебышeв”. Для реализации параллельности вычислений использовался MPI. Данная работа выполнена в рамках проведения научно-исследовательских работ по пост-геномным исследованиям и технологиям МГУ им. М.В. Ломоносова и выполнения работ по госконтракту 02.740.11.0388 по теме “Суперкомпьютерные технологии для решения задач обработки, хранения, передачи и защиты информации”, а также частично поддержана грантами РФФИ (коды проектов 09-01-12097_офи-м, 10-07-00595-а).

Ключевые слова: докинг; высокопроизводительные вычисления; интерфейс передачи сообщений.

Полный текст: PDF файл (966 kB)
Тип публикации: Статья
УДК: 519.6

Образец цитирования: И. В. Офёркин, А. В. Сулимов, О. А. Кондакова, В. Б. Сулимов, “Реализация поддержки параллельных вычислений в программах докинга SOLGRID и SOL”, Выч. мет. программирование, 12:1 (2011), 9–23

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{OfeSulKon11}
\by И.~В.~Офёркин, А.~В.~Сулимов, О.~А.~Кондакова, В.~Б.~Сулимов
\paper Реализация поддержки параллельных вычислений в программах
докинга SOLGRID и SOL
\jour Выч. мет. программирование
\yr 2011
\vol 12
\issue 1
\pages 9--23
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/vmp216}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/vmp216
  • http://mi.mathnet.ru/rus/vmp/v12/i1/p9

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Вычислительные методы и программирование
    Просмотров:
    Эта страница:76
    Полный текст:36
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2021