RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Выч. мет. программирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Выч. мет. программирование, 2012, том 13, выпуск 3, страницы 391–397 (Mi vmp43)  

Вычислительные методы и приложения

Расчет энергии Гиббса образования межмолекулярных комплексов методом термодинамического интегрирования с использованием гармонических ограничений на движение атомов

Ф. В. Григорьев

Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр

Аннотация: Предложен новый способ построения термодинамического цикла для расчета энергии Гиббса образования межмолекулярных комплексов методом термодинамического интегрирования с использованием гармонических ограничений, накладываемых на координаты атомов. Траектория, по которой ведется интегрирование, получена методом молекулярной динамики с использованием силового поля MMFF94 для расчета потенциальной энергии межатомного взаимодействия. Показано, что предложенный способ построения термодинамического цикла обеспечивает корректный учет потенциала, обеспечивающего гармонические ограничения, а также минимизирует флуктуации потенциальной энергии комплекса при промежуточных значениях переменной интегрирования. С использованием предложенного подхода проведены расчеты энергии Гиббса для комплекса бензол-циклодекстрин.

Ключевые слова: термодинамическое интегрирование; свободная энергия образования комплексов; константа связывания; термодинамический цикл.

Полный текст: PDF файл (182 kB)
Тип публикации: Статья
УДК: 536.75; 538.9
Поступила в редакцию: 04.06.2012

Образец цитирования: Ф. В. Григорьев, “Расчет энергии Гиббса образования межмолекулярных комплексов методом термодинамического интегрирования с использованием гармонических ограничений на движение атомов”, Выч. мет. программирование, 13:3 (2012), 391–397

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Gri12}
\by Ф. В.~Григорьев
\paper Расчет энергии Гиббса образования межмолекулярных комплексов методом термодинамического интегрирования с использованием гармонических ограничений на движение атомов
\jour Выч. мет. программирование
\yr 2012
\vol 13
\issue 3
\pages 391--397
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/vmp43}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/vmp43
  • http://mi.mathnet.ru/rus/vmp/v13/i3/p391

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Вычислительные методы и программирование
    Просмотров:
    Эта страница:140
    Полный текст:85
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2021