RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Выч. мет. программирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Выч. мет. программирование, 2007, том 8, выпуск 4, страницы 326–333 (Mi vmp498)  

Вычислительные методы и приложения

Двухступенчатая методика расчета свободной энергии образования субнанометровых полостей в воде методом термодинамического интегрирования

Ф. В. Григорьев, А. Н. Романов, В. Б. Сулимов

Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета имени М. В. Ломоносова

Аннотация: В работе представлена оригинальная двухступенчатая схема расчета свободной энергии образования полостей различных объема и формы в воде методом термодинамического интегрирования. Статистические интегралы вычисляются с использованием моделирования ансамбля молекул воды методом Монте-Карло с наложением периодических граничных условий. Реализация предложенной схемы осуществлена в программе CAVE (CAVity free Energy). С целью определения оптимальных параметров моделирования в рамках предложенного алгоритма проведены тестовые расчеты по определению свободной энергии кавитации для сферы, а также для нескольких органических молекул малого и среднего размера. Взаимодействие между молекулами воды описывалось в рамках четырехточечной неполяризуемой модели TIP4P. Для тестирования программы CAVE с ее использованием был рассчитан при нормальных условиях ряд термодинамических характеристик TIP4P-модели. Все найденные величины совпадают в пределах погрешностей с известными ранее. Работа выполнена при финансовой поддержке РФФИ (код проекта 06-03-33171).

Ключевые слова: свободная энергия сольватации; свободная энергия кавитации; модель воды; моделирование методом Монте-Карло; численное интегрирование.

Полный текст: PDF файл (284 kB)
УДК: 536.75, 538.9

Образец цитирования: Ф. В. Григорьев, А. Н. Романов, В. Б. Сулимов, “Двухступенчатая методика расчета свободной энергии образования субнанометровых полостей в воде методом термодинамического интегрирования”, Выч. мет. программирование, 8:4 (2007), 326–333

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{GriRomSul07}
\by Ф.~В.~Григорьев, А.~Н.~Романов, В.~Б.~Сулимов
\paper Двухступенчатая методика расчета свободной энергии образования
субнанометровых полостей в воде методом термодинамического интегрирования
\jour Выч. мет. программирование
\yr 2007
\vol 8
\issue 4
\pages 326--333
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/vmp498}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/vmp498
  • http://mi.mathnet.ru/rus/vmp/v8/i4/p326

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Вычислительные методы и программирование
    Просмотров:
    Эта страница:64
    Полный текст:16
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2021