RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Выч. мет. программирование:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Выч. мет. программирование, 2012, том 13, выпуск 4, страницы 536–550 (Mi vmp60)  

Вычислительные методы и приложения

Исследования влияния параметров генетического алгоритма на эффективность докинга с помощь программы SOL

Е. В. Каткова

Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова, физический факультет,

Аннотация: Проведен анализ ключевых параметров генетического алгоритма и изучено их влияние на эффективность процедуры докинга (позиционирования низкомолекулярных веществ в активном центре молекулы белка), реализованного в многопроцессорной версии программы SOL. Тестирование проводилось на наборе структур, представляющих собой комплексы белка урокиназы, закристаллизованной с различными низкомолекулярными ингибиторами (лигандами), и было ориентировано на оптимизацию дальнейшей работы по поиску новых ингибиторов урокиназы как потенциальных противоопухолевых препаратов. Оптимальные значения параметров генетического алгоритма получены как для режима, в котором проводится докинг одной молекулы, так и для режима виртуального скрининга, т.е. докинга больших библиотек химических соединений. Тестирование проводилось на кластерных суперкомпьютерах Московского государственного университета “Чебышев” и “Ломоносов”.

Ключевые слова: докинг; разработка лекарственных средств; генетический алгоритм; глобальная оптимизация; параметризация.

Полный текст: PDF файл (263 kB)
Тип публикации: Статья
УДК: 519.688
Поступила в редакцию: 11.09.2012

Образец цитирования: Е. В. Каткова, “Исследования влияния параметров генетического алгоритма на эффективность докинга с помощь программы SOL”, Выч. мет. программирование, 13:4 (2012), 536–550

Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{Kat12}
\by Е. В.~Каткова
\paper Исследования влияния параметров генетического алгоритма на эффективность докинга с помощь программы SOL
\jour Выч. мет. программирование
\yr 2012
\vol 13
\issue 4
\pages 536--550
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/vmp60}


Образцы ссылок на эту страницу:
  • http://mi.mathnet.ru/vmp60
  • http://mi.mathnet.ru/rus/vmp/v13/i4/p536

    ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru


    Citing articles on Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles on Google Scholar: Russian articles, English articles
  • Вычислительные методы и программирование
    Просмотров:
    Эта страница:214
    Полный текст:37
     
    Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2020