RUS  ENG ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ЛИЧНЫЙ КАБИНЕТ
Видеотека
Архив
Популярное видео

Поиск
RSS
Новые поступления





Для просмотра файлов Вам могут потребоваться






Новые направления в математической и теоретической физике
7 октября 2016 г. 11:00, г. Москва, МИАН, ул. Губкина, д. 8
 


Kinetics of CO connection using mioglobin: rigorous analytic results and predictions

Albert Bikulov, A.P. Zubarev

N. N. Semenov Institute of Chemical Physics, Russian Academy of Sciences, Moscow
Видеозаписи:
MP4 885.1 Mb
MP4 224.5 Mb

Количество просмотров:
Эта страница:64
Видеофайлы:24

Albert Bikulov, A.P. Zubarev
Фотогалерея


Видео не загружается в Ваш браузер:
  1. Установите Adobe Flash Player    

  2. Проверьте с Вашим администратором, что из Вашей сети разрешены исходящие соединения на порт 8080
  3. Сообщите администратору портала о данной ошибке

Аннотация: В экспериментах по исследованию динамики и функций белка особое место занимает кинетика связывания $CO$ миоглобином [ABB_et_al,SAB_et_al]. Эти эксперименты были проведены на большой шкале временных масштабах ($10^{-7}-10^{2}$ c) и в широком диапазоне температур ($60-300$ К). В этих экспериментах сразу обращает на себя внимание тот факт, что в высокотемпературной ($200-300$ K) и низкотемпературной ($60-190$ К) областях кинетика связывания существенно различаются. В одном и том же временном окне наблюдения кинетические кривые можно аппроксимировать степенными законами. При этом в высокотемпературной области на степенном участке кривой кинетика связывания описывается аномальной температурной зависимостью. В низкотемпературной области в том же окне наблюдения кинетика описывается также степенной функцией, но с нормальной температурной зависимостью. Другими словами имеет место скачкообразное изменение показателей степенных аппроксимаций в узкой температурной зоне от $180$ до $200$ К, меняющее температурную зависимость скорости реакций на прямо противоположную. Этот факт как иыяснилось вызывает основное затруднение в построении теории, описывающей единым образом кинетику связывания $CO$ миоглобином во всем диапазоне температур. В нашей обзорной статье [ABZ] дан анализ наиболее разумных попыток построения таких теорий. В этой же работе была предложена ультраметрическая модель кинетики связывания $CO$, которая была исследована численно. Как оказалось данная модель правильно воспроизводит температурную зависимость показателя степени кинетических кривых во всем диапазоне температур от $60$ до $300$ К. В данном докладе приводим математически строгое описание модели, предложенной в [ABZ]. Мы аналитически находим зависимость показателей степеней кинетических кривых от температуры как в высокотемпературной, так и в низкотемпературной областях. Мы также обсуждаем важную особенность рассматриваемой модели, которая заключается в том, что при увеличении времени наблюдения на низкотемпературных кинетических кривых появляется второй степенной участок, который имеет аномальную температурную зависимость. Возможно, что этот факт может служить основанием для предсказания будущих экспериментов по кинетики связывания белков с лигандами.

Язык доклада: английский

Список литературы
  1. Ansary A., Berendzen J., Bowne S.F., et al., “Protein states and proteinquakes”, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82 (1985), 5000–5004  crossref
  2. Steinbach P.J., Ansary A., Berendzen J., et al, “Ligand binding to heme proteins: connection between dynamics and function”, Biochemistry, 30 (1991), 3988–4001  crossref  isi
  3. Avetisov V. A., Bikulov A. Kh., Zubarev A. P., “Ultrametric random walk and dynamics of protein molecule”, Tr. Mat. Inst. Steklova, 285 (2014), 9–32  mathnet


ОТПРАВИТЬ: VKontakte.ru FaceBook Twitter Mail.ru Livejournal Memori.ru
 
Обратная связь:
 Пользовательское соглашение  Регистрация  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2017