|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
05.13.00 ИНФОРМАТИКА, ВЫЧИСЛИТЕЛЬНАЯ ТЕХНИКА И УПРАВЛЕНИЕ
05.13.18 МАТЕМАТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ, ЧИСЛЕННЫЕ МЕТОДЫ И КОМПЛЕКСЫ ПРОГРАММ
Квантильное преобразование в задачах структурной биоинформатики
С. В. Полуянa, Н. М. Ершовb a Институт системного анализа и управления, Государственный Университет «Дубна»
b Московский государственный университет им. М.В. Ломоносова
Аннотация:
Настоящая работа посвящена особенностям реализации многомерной эмпирической квантильной функции, для которой элементы выборки распределены на узлах регулярной сетки. В работе приведено краткое «рекурсивное» определение структуры многомерной квантильной функции и предложен алгоритм, позволяющий выполнять как дискретное, так и непрерывное многомерное квантильное преобразование. Приводятся результаты численного исследования представленного алгоритма преобразования и показана вычислительная сложность в зависимости от способа хранения выборки. Продемонстрированы результаты применения эволюционных алгоритмов оптимизации с использованием квантильного преобразования в двух задачах структурной биоинформатики: задаче предсказания пространственной структуры пептида по аминокислотной последовательности и задаче локального пептид-белок докинга с известным линейным интерфейсом связывания и линейной структурой пептида.
Ключевые слова:
эмпирическая квантильная функция, конечный автомат, глобальная оптимизация.
Поступила в редакцию: 16.12.2019
Образец цитирования:
С. В. Полуян, Н. М. Ершов, “Квантильное преобразование в задачах структурной биоинформатики”, Comp. nanotechnol., 6:4 (2019), 29–43
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/cn274 https://www.mathnet.ru/rus/cn/v6/i4/p29
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 148 | PDF полного текста: | 25 | Список литературы: | 1 |
|