Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2007, том 2, выпуск 1, страницы 20–35 (Mi mbb14)  

Эта публикация цитируется в 6 научных статьях (всего в 6 статьях)

Материалы Международной конференции «Математическая биология и биоинформатика»

Совместное использование различных критериев проверки однородности для выявления скрытой периодичности в биологических последовательностях

М. Б. Чалейa, Н. Н. Назиповаa, В. А. Кутыркинb

a Институт математических проблем биологии РАН
b Московский государственный технический университет им. Н. Э. Баумана
Список литературы:
Аннотация: В настоящей работе для выявления скрытой периодичности в биологических последовательностях используется модель дополнительных статистических экспериментов. Эта модель, включающая понятие нечетких тандемных повторов (Fuzzy Tandem Repeats), позволила предложить оригинальные статистические методы для оценки паттерна периодичности в размытых тандемных повторах (Approximate Tandem Repeats). В ряде случаев, при существенном проценте вставок и делеций в последовательности размытого тандемного повтора, выравнивание на основе полученной оценки размера паттерна периодичности оказывается более оптимальным по сравнению с выравниванием на основе известного метода Tandem Repeats Finder (TRF). Предложенные оригинальные статистические методы обладают значительно большей мощностью по сравнению с существующими аналогами. Основное достоинство этих методов состоит в возможности их применения в практических условиях нерепрезентативных выборок.
Ключевые слова: скрытая периодичность, тест-период, профильная матрица, спектр относительных $\chi^2$-амплитуд.
Материал поступил в редакцию 30.03.2007, опубликован 22.04.2007
Тип публикации: Статья
УДК: 577.2:519.23
Образец цитирования: М. Б. Чалей, Н. Н. Назипова, В. А. Кутыркин, “Совместное использование различных критериев проверки однородности для выявления скрытой периодичности в биологических последовательностях”, Матем. биология и биоинформ., 2:1 (2007), 20–35
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{ChaNazKut07}
\by М.~Б.~Чалей, Н.~Н.~Назипова, В.~А.~Кутыркин
\paper Совместное использование различных критериев проверки однородности для выявления скрытой
периодичности в~биологических последовательностях
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2007
\vol 2
\issue 1
\pages 20--35
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb14}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb14
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v2/i1/p20
  • Эта публикация цитируется в следующих 6 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:360
    PDF полного текста:121
    Список литературы:71
    Первая страница:1
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024