|
Математическая биология и биоинформатика, 2013, том 8, выпуск 2, страницы 529–536
(Mi mbb160)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Комментарии
К вопросу о распознавании скрытой периодичности в последовательностях ДНК
Е. В. Коротковab, А. А. Шеленковb, М. А. Коротковаa a Национальный исследовательский ядерный университет (МИФИ), Москва, 115409, Россия
b Центр «Биоинженерия», Российская академия наук, Москва, 117312, Россия
Аннотация:
В данной работе мы сравнили метод информационного разложения (ИР) и спектрально-статистический подход (СС). Мы показываем, что СС подход не учитывает влияния малой выборки, а выделение статистически значимого периода в последовательности оснований ДНК СС подход проводит математически некорректно. Обнаружение «профильной периодичности» СС подходом зависит исключительно от соотношения длин скрытых периодов. Обнаруженные недостатки СС подхода показывают, что для поиска районов ДНК со скрытой периодичностью в нуклеотидных последовательностях более корректно использовать статистику Z и метод ИР.
Ключевые слова:
Скрытая периодичность, информационное разложение, спектрально-статистический подход, гены, триплетная периодичность, профильная периодичность.
Материал поступил в редакцию 14.10.2013, опубликован 21.11.2013
Образец цитирования:
Е. В. Коротков, А. А. Шеленков, М. А. Короткова, “К вопросу о распознавании скрытой периодичности в последовательностях ДНК”, Матем. биология и биоинформ., 8:2 (2013), 529–536
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb160 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v8/i2/p529
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 321 | PDF полного текста: | 98 | Список литературы: | 58 | Первая страница: | 1 |
|