|
Математическое моделирование, 1993, том 5, номер 6, страницы 24–55
(Mi mm1981)
|
|
|
|
Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)
Математические модели и вычислительный эксперимент
Изучение модели процесса сворачивания тРНК во вторичную структуру
Н. Н. Козлов, Е. И. Кугушев Институт прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН
Аннотация:
Представляются результаты компьютерного моделирования процесса сворачивания линейных молекул РНК во вторичную структуру.Структура формируется в ходе взаимодействия двух процессов: молекулярного роста – последовательного роста цепи молекулы РНК и структуризации – последовательного постепенного возникновения и роста вторичной структуры в пределах уже выросшего участка молекулярной цепи. В ходе структуризации вторичная структура формируется путем последовательного
добавления в нее элементарных подструктур – стеблей.При этом происходит локальная минимизация приращения свободной энергии на множестве допустимых стеблей. Предложен алгоритм расчета, использование которого привело к ускорению вычислительного процесса более чем на два порядка и позволило исследовать формирование структур для полного набора генетических текстов молекул тРНК, полученных в мире на начало 1990 года. Проведен анализ решений в пространстве двух параметров, получена асимметрия решений в зависимости от направления роста молекулярной цепи. В ходе исследования был получен наиболее высокий средний процент предсказания вторичной структуры тРНК (для изученных моделей свободной энергии) – более 86%.
Поступила в редакцию: 30.07.1992
Образец цитирования:
Н. Н. Козлов, Е. И. Кугушев, “Изучение модели процесса сворачивания тРНК во вторичную структуру”, Матем. моделирование, 5:6 (1993), 24–55
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mm1981 https://www.mathnet.ru/rus/mm/v5/i6/p24
|
Статистика просмотров: |
Страница аннотации: | 485 | PDF полного текста: | 411 | Первая страница: | 1 |
|