Институт был организован на основании Постановления Президиума Академии наук СССР № 80 от 18 февраля 1987 года на базе пяти отделов радиокосмофизического профиля Северо-Восточного комплексного научно-исследовательского института (КНИИ) ДВО АН СССР. В состав института вошли: Отдел Электромагнитного поля Земли (с. Паратунка Камчатской обл.), Уссурийская астрофизическая обсерватория (с. Горнотаежное Приморского края), Отделы и лаборатории, расположенные в п. Мыс Шмидта, в п. Стекольный Магаданской области, в с. Забайкальское Хабаровского края, на острове Сахалин. В 1992 Уссурийская астрофизическая обсерватория ДВО РАН вышла из состава Института, став самостоятельной обсерваторией. В 2006 году Геомагнитная обсерватория на о. Сахалине была законсервирована.

На основании постановления Центрального комитета КПСС и СМ СССР № 1088 от 26 сентября 1987 года, постановления Президиума Академии наук СССР от 22 января 1988 года № 12 Дальневосточный научный центр Академии наук СССР преобразован в Дальневосточное отделение Академии наук СССР.

Указом Президента РСФСР от 21.11.1991 г. № 228 «Об организации Российской академии наук» Институт космофизических исследований и распространения радиоволн Дальневосточного отделения Академии наук СССР был переименован в Институт космофизических исследований и распространения радиоволн Дальневосточного отделения Российской академии наук.

Постановлением Президиума Российской академии наук от 18.12.2007 г. № 274 «О переименовании организаций, подведомственных Российской академии наук» Институт космофизических исследований и распространения радиоволн Дальневосточного отделения Российской академии наук переименован в Учреждение Российской академии наук Институт космофизических исследований и распространения радиоволн Дальневосточного отделения Российской академии наук.

На основании постановления Президиума Российской академии наук от 13.12.2011 г. № 262 Учреждение Российской академии наук Институт космофизических исследований и распространения радиоволн Дальневосточного отделения Российской академии наук переименовано в Федеральное государственное бюджетное учреждение науки Институт космофизических исследований и распространения радиоволн Дальневосточного отделения Российской академии наук.

В составе института 5 научных лабораторий, 4 дистанционно разнесенных геофизических обсерватории («Мыс Шмидта», «Хабаровск», «Паратунка», «Магадан») и 2 круглогодичных экспедиционных пункта.

Структура института

ИКИР ДВО РАН – единственный институт в России, имеющий три магнитных обсерватории, сертифицированные как обсерватории международной сети INTERMAGNET ("Магадан" с 2009 г. и "Паратунка" и "Хабаровск" с 2013 г.). Ионосферные станции ИКИР ("Магадан", "Паратунка" и "Хабаровск") работают по программе URSI по вертикальному зондированию ионосферы. Нейтронные мониторы космических лучей обсерваторий "Магадан" и "Мыс Шмидта" включены в международную сеть.

Основные научные направления:

физика солнечно-земных связей; фундаментальные проблемы распространения радиоволн; радиофизические и акустические методы диагностики окружающей среды.