|
Эта публикация цитируется в 1 научной статье (всего в 1 статье)
Математическое моделирование
Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы
А. В. Сюракшинa, В. Д. Лахноb, В. Ю. Юшанхайcd a Естественнонаучный институт, Самарский национальный исследовательский университет им. С.П. Королева, Самара, Россия
b Институт математических проблем биологии РАН— филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия
c Лаборатория теоретической физики им. Н.Н. Боголюбова, ОИЯИ, Дубна, Россия
d Государственный университет "Дубна", Дубна, Россия
Аннотация:
Исследована предложенная ранее Скуртисом и Нитцаном и обобщенная в данной работе квантово-статистическая модель переноса заряда по фрагменту искусственного ДНК. В рамках предлагаемой модели проведено численное моделирование транспорта заряженного носителя с учетом двух различных диссипативных процессов, включая захват носителя окружающей средой и декогеренцию его квантово-волнового движения за счет воздействия со стороны стохастических полей окружения. Взаимодействие носителя с окружением регулируется небольшим набором феноменологических параметров численные значения которых варьируются в процессе моделирования. Наблюдаемые характеристики движения заряда по молекуле ДНК сравниваются с решением квантового основного уравнения Коссаковского–Линдблада–Глаубера–Сударшана (далее уравнение Линдблада) для матрицы плотности носителя с использованием программы Lindblad MPO Solver. Полученные в этом подходе результаты численного анализа модели согласуются с экспериментальными наблюдениями и демонстрируют два режима движения заряженного носителя, предположительно – туннельный и прыжковый, в коротких и длинных фрагментах ДНК, соответственно. В заключении кратко обсуждаются основные концепции теории непрерывного измерения, декогеренции и суперотбора для открытых квантовых систем и перспективы их применения для дальнейшего изучения переноса заряда в молекуле ДНК.
Ключевые слова:
электронная структура ДНК, моделирование процесса переноса заряда в ДНК, открытая квантовая система, уравнение Линдблада.
Материал поступил в редакцию 17.04.2024, 24.05.2024, опубликован 26.06.2024
Образец цитирования:
А. В. Сюракшин, В. Д. Лахно, В. Ю. Юшанхай, “Компьютерное моделирование переноса заряда в молекуле ДНК в рамках простой модели открытой квантовой системы”, Матем. биология и биоинформ., 19:1 (2024), 212–231
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb555 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v19/i1/p212
|
|