Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2024, том 19, выпуск 2, страницы 322–337
DOI: https://doi.org/10.17537/2024.19.322
(Mi mbb562)
 

Биоинформатика

Моделирование структуры белка tRolC Nicotiana tabacum и его функциональная связь с другими белками

А. Д. Цветковаa, Д. Ю. Швецbc, Х. Г. Мусинc, Б. Р. Кулуевac

a Уфимский университет науки и технологий, Уфа, Россия
b Башкирский государственный медицинский университет, Уфа, Россия
c Институт биохимии и генетики – обособленное структурное подразделение Федерального государственного бюджетного научного учреждения Уфимского федерального исследовательского центра Российской академии наук, Уфа, Россия
Список литературы:
Аннотация: Ген trolC является гомологом онкогена rolC Agrobacterium rhizogenes и попал в геном Nicotiana tabacum, вероятнее всего, в результате горизонтального переноса генов. Этот ген довольно консервативен, экспрессируется в молодых органах, однако его функции, как и агробактериального гена rolC, остаются неизвестными. В настоящей работе проанализирована предположительная структура белка tRolC Nicotiana tabacum, предсказанная с помощью сервиса I-TASSER. Наличие у белка tRolC аминокислотных остатков активного центра и сайта связывания, а также белок-связывающей и ARTT-петли, сходных по структуре с белком 6b Agrobacterium vitis, свидетельствует о выполнении ими сходных биологических функций. На основе полученных данных высказана гипотеза о наличии у белка tRolC АДФ-рибозилтрансферазной активности, позволяющей ему влиять на рост и устойчивость растений к стрессам, а также на биосинтез вторичных метаболитов посредством влияния на регуляцию экспрессии генов через взаимодействие с факторами транскрипции, компонентами РНК-интерференции или проявление гистоноподобной активности.
Ключевые слова: Agrobacterium rhizogenes, rol-гены, rolC, белок 6b, АДФ-рибозилтрансферазы, компьютерное моделирование.
Материал поступил в редакцию 08.08.2024, 16.09.2024, опубликован 28.09.2024
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: А. Д. Цветкова, Д. Ю. Швец, Х. Г. Мусин, Б. Р. Кулуев, “Моделирование структуры белка tRolC Nicotiana tabacum и его функциональная связь с другими белками”, Матем. биология и биоинформ., 19:2 (2024), 322–337
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{TsvShvMus24}
\by А.~Д.~Цветкова, Д.~Ю.~Швец, Х.~Г.~Мусин, Б.~Р.~Кулуев
\paper Моделирование структуры белка tRolC \emph{Nicotiana tabacum} и его функциональная связь с другими белками
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2024
\vol 19
\issue 2
\pages 322--337
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb562}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2024.19.322}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb562
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v19/i2/p322
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:107
    PDF полного текста:57
    Список литературы:26
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025