Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2024, том 19, выпуск 2, страницы 418–426
DOI: https://doi.org/10.17537/2024.19.418
(Mi mbb568)
 

Математическое моделирование

Исследование эффектов полиглутамилирования С-концевых участков $\alpha$-тубулина методом полноатомной молекулярной динамики

Е. Г. Холина, Н. Б. Гудимчук

Московский государственный университет имени М. В. Ломоносова, Москва, Россия
Список литературы:
Аннотация: Тубулиновый цитоскелет, состоящий из сети микротрубочек, является ключевой внутриклеточной системой, обеспечивающей выполнение множества жизненно важных функций в клетке. Его работа регулируется посттрансляционными модификациями, которые записываются и редактируются ферментами, распознаются регуляторными белками или напрямую влияют на свойства тубулинов. Одной из таких модификаций является полиглутамилирование C-концевых участков тубулина. В данной работе мы изучили влияние добавления дополнительных остатков глутамата на динамику C-концевых участков $\alpha$-тубулина и их взаимодействия с глобулярными доменами тубулина методом полноатомного молекулярно-динамического моделирования. Анализ совокупности расчётов общей продолжительностью более трёх микросекунд для модифицированного и немодифицированного тубулина показал, что полиглутамилирование уменьшает среднее расстояние между основанием и концом неструктурированного C-концевого участка, увеличивая вероятность его контакта с глобулярной частью белка, включая полимеризационный интерфейс. Полученные результаты позволяют предположить, что полиглутамилирование C-концевых участков $\alpha$-тубулина может быть фактором, влияющим на кинетику сборки микротрубочек.
Ключевые слова: тубулин, посттрансляционные модификации, полиглутамилирование, молекулярная динамика, компьютерное моделирование.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский научный фонд 23-74-00007
Исследование выполнено за счет гранта Российского научного фонда № 23-74-00007, https://rscf.ru/en/project/23-74-00007/.
Материал поступил в редакцию 25.09.2024, 27.11.2024, опубликован 04.12.2024
Реферативные базы данных:
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: Е. Г. Холина, Н. Б. Гудимчук, “Исследование эффектов полиглутамилирования С-концевых участков $\alpha$-тубулина методом полноатомной молекулярной динамики”, Матем. биология и биоинформ., 19:2 (2024), 418–426
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{KhoGud24}
\by Е.~Г.~Холина, Н.~Б.~Гудимчук
\paper Исследование эффектов полиглутамилирования С-концевых участков $\alpha$-тубулина методом полноатомной молекулярной динамики
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2024
\vol 19
\issue 2
\pages 418--426
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb568}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2024.19.418}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=79883901}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb568
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v19/i2/p418
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:104
    PDF полного текста:50
    Список литературы:30
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025