Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2025, том 20, выпуск 1, страницы 31–46
DOI: https://doi.org/10.17537/2025.20.31
(Mi mbb582)
 

Математическое моделирование

О термализации одномерных решеток. II. Канонический ансамбль

Г. А. Виноградовa, В. Д. Лахноb

a Институт биохимической физики им. Н.М. Эмануэля РАН, Москва, Россия
b Институт математических проблем биологии РАН— филиал ИПМ им. М.В. Келдыша РАН, Пущино, Россия
Аннотация: В работе рассмотрена термализация одномерных решеток в каноническом ансамбле. Описаны основные методы термализации, в том числе алгоритм Нозе – Хувера и стохастический метод Ланжевена. Подробно рассмотрена термализация решеток с “жестким” симметричным потенциалом $\beta$-Fermi–Pasta–Ulam–Tsingou ($\beta$-FPUT). На этом примере продемонстрированы количественные и качественные характеристики процесса термализации. В следующем разделе проанализирована термализация решетки с “мягким” асимметричным потенциалом Peyrard–Bishop–Holstein (PBH). Термализация этой решетки имеет некоторые особенности, связанные с видом потенциала Морзе, который моделирует водородные связи между цепями ДНК. В заключение упомянута проблема квантовой термализации, когда учитывается квантовый характер колебательного движения атомов молекулярной цепи.
Ключевые слова: канонический ансамбль, термализация, термостат Ланжевена.
Материал поступил в редакцию 16.12.2024, 30.12.2024
Англоязычная версия:
Mathematical Biology and Bioinformatics, 2025, Volume 20, Pages t13–t27
DOI: https://doi.org/10.17537/2025.20.t13
Реферативные базы данных:
Тип публикации: Статья
Образец цитирования: Г. А. Виноградов, В. Д. Лахно, “О термализации одномерных решеток. II. Канонический ансамбль”, Матем. биология и биоинформ., 20:1 (2025), 31–46; Mat. Biolog. Bioinform., 20 (2025), t13–t27
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{VinLak25}
\by Г.~А.~Виноградов, В.~Д.~Лахно
\paper О термализации одномерных решеток.~II. Канонический ансамбль
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2025
\vol 20
\issue 1
\pages 31--46
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb582}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2025.20.31}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=82649565}
\transl
\jour Mat. Biolog. Bioinform.
\yr 2025
\vol 20
\pages t13--t27
\crossref{https://doi.org/10.17537/2025.20.t13}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb582
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v20/i1/p31
    Цикл статей
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025