|
Математическое моделирование
Investigating the endocrine disruption potential of sclareol through docking and molecular dynamics simulation methods
[Оценка потенциала влияния склареола на эндокринные нарушения с помощью методов докинга и молекулярно-динамического моделирования]
R. Satpathya, P. Padhana, R. Beherab, J. Rathac a School of Biotechnology, Gangadhar Meher University, Amruta Vihar, Sambalpur, Odisha, India
b MITS School of Biotechnology, Bhubaneswar, Odisha, India
c School of Life Sciences, Sambalpur University, Jyoti Vihar, Burla, Odisha, India
Аннотация:
Природные фитохимические вещества из мускатного шалфея (Salvia sclarea) широко используются в косметической и парфюмерной промышленности. Однако их потенциальная активность в отношении модуляции эндокринной системы остается неизученной. Целью данного исследования является оценка эндокринно-нарушающей активности выбранных фитохимических веществ из Salvia sclarea с использованием подхода in silico. Молекулярная стыковка была выполнена для исследования взаимодействий между этими фитохимическими веществами и шестью гормональными рецепторами. Сравнительное моделирование молекулярной динамики и расчеты молекулярной механики площади поверхности Пуассона–Больцмана были выполнены для молекулы с лучшим связыванием. Токсикологическая оценка была выполнена с использованием сервера Protox III. Дитерпеновый склареол показал оценку докинга -8,7 ккал/моль, занимая позицию связывания, аналогичную гормону тироксину на тиреоидном рецепторе. 100-Наносекундное молекулярнодинамическое моделирование и молекулярномеханический анализ поверхности Пуассона–Больцмана подтвердили благоприятное связывание склареола с тиреоидным рецептором. Токсикологическая оценка предсказала активную респираторную токсичность для соединения склареола. Результаты указывают на потенциальную эндокринную нарушающую природу склареола, что требует дальнейшего исследования для полного понимания его модуляторной активности.
Ключевые слова:
нарушающие работу эндокринной системы химикаты, фитохимические вещества, Salvia sclarea, молекулярный докинг, тиреоидный рецептор, моделирование молекулярной динамики.
Материал поступил в редакцию 07.02.2025, 14.05.2025, опубликован 27.05.2025
Образец цитирования:
R. Satpathy, P. Padhan, R. Behera, J. Ratha, “Investigating the endocrine disruption potential of sclareol through docking and molecular dynamics simulation methods”, Матем. биология и биоинформ., 20:1 (2025), 122–134
Образцы ссылок на эту страницу:
https://www.mathnet.ru/rus/mbb589 https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v20/i1/p122
|
|