Математическая биология и биоинформатика
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив
Импакт-фактор

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Матем. биология и биоинформ.:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Математическая биология и биоинформатика, 2025, том 20, выпуск 1, страницы 122–134
DOI: https://doi.org/10.17537/2025.20.122
(Mi mbb589)
 

Математическое моделирование

Investigating the endocrine disruption potential of sclareol through docking and molecular dynamics simulation methods
[Оценка потенциала влияния склареола на эндокринные нарушения с помощью методов докинга и молекулярно-динамического моделирования]

R. Satpathya, P. Padhana, R. Beherab, J. Rathac

a School of Biotechnology, Gangadhar Meher University, Amruta Vihar, Sambalpur, Odisha, India
b MITS School of Biotechnology, Bhubaneswar, Odisha, India
c School of Life Sciences, Sambalpur University, Jyoti Vihar, Burla, Odisha, India
Аннотация: Природные фитохимические вещества из мускатного шалфея (Salvia sclarea) широко используются в косметической и парфюмерной промышленности. Однако их потенциальная активность в отношении модуляции эндокринной системы остается неизученной. Целью данного исследования является оценка эндокринно-нарушающей активности выбранных фитохимических веществ из Salvia sclarea с использованием подхода in silico. Молекулярная стыковка была выполнена для исследования взаимодействий между этими фитохимическими веществами и шестью гормональными рецепторами. Сравнительное моделирование молекулярной динамики и расчеты молекулярной механики площади поверхности Пуассона–Больцмана были выполнены для молекулы с лучшим связыванием. Токсикологическая оценка была выполнена с использованием сервера Protox III. Дитерпеновый склареол показал оценку докинга -8,7 ккал/моль, занимая позицию связывания, аналогичную гормону тироксину на тиреоидном рецепторе. 100-Наносекундное молекулярнодинамическое моделирование и молекулярномеханический анализ поверхности Пуассона–Больцмана подтвердили благоприятное связывание склареола с тиреоидным рецептором. Токсикологическая оценка предсказала активную респираторную токсичность для соединения склареола. Результаты указывают на потенциальную эндокринную нарушающую природу склареола, что требует дальнейшего исследования для полного понимания его модуляторной активности.
Ключевые слова: нарушающие работу эндокринной системы химикаты, фитохимические вещества, Salvia sclarea, молекулярный докинг, тиреоидный рецептор, моделирование молекулярной динамики.
Материал поступил в редакцию 07.02.2025, 14.05.2025, опубликован 27.05.2025
Реферативные базы данных:
Тип публикации: Статья
Язык публикации: английский
Образец цитирования: R. Satpathy, P. Padhan, R. Behera, J. Ratha, “Investigating the endocrine disruption potential of sclareol through docking and molecular dynamics simulation methods”, Матем. биология и биоинформ., 20:1 (2025), 122–134
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{SatPadBeh25}
\by R.~Satpathy, P.~Padhan, R.~Behera, J.~Ratha
\paper Investigating the endocrine disruption potential of sclareol through docking and molecular dynamics simulation methods
\jour Матем. биология и биоинформ.
\yr 2025
\vol 20
\issue 1
\pages 122--134
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/mbb589}
\crossref{https://doi.org/10.17537/2025.20.122}
\elib{https://elibrary.ru/item.asp?id=82649571}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb589
  • https://www.mathnet.ru/rus/mbb/v20/i1/p122
  • Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2025