Препринты Института прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН
RUS  ENG    ЖУРНАЛЫ   ПЕРСОНАЛИИ   ОРГАНИЗАЦИИ   КОНФЕРЕНЦИИ   СЕМИНАРЫ   ВИДЕОТЕКА   ПАКЕТ AMSBIB  
Общая информация
Последний выпуск
Архив

Поиск публикаций
Поиск ссылок

RSS
Последний выпуск
Текущие выпуски
Архивные выпуски
Что такое RSS



Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша:
Год:
Том:
Выпуск:
Страница:
Найти






Персональный вход:
Логин:
Пароль:
Запомнить пароль
Войти
Забыли пароль?
Регистрация


Препринты Института прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН, 2018, 027, 28 стр.
DOI: https://doi.org/10.20948/prepr-2018-27-e
(Mi ipmp2389)
 

Эта публикация цитируется в 2 научных статьях (всего в 2 статьях)

Quantum-classical modeling of rhodopsin photoisomerization
[Квантово-классическое моделирование фотоизомеризации родопсина]

A. S. Shigaev, T. B. Feldman, V. A. Nadtochenko, M. A. Ostrovsky, V. D. Lakhno
Список литературы:
Аннотация: Показана сводимость описания первичных событий цис-транс фотоизомеризации родопсинового хромофора (ретиналя) к минимальной одномерной квантово-классической математической модели. Разработанная модель аналогична традиционным квантово-классическим подходам и не требует сложных квантовохимических и молекулярно-динамических расчëтов. Квантовая подсистема модели включает 3 электронных состояния родопсина: (1) основное состояние, (2) возбуждëнное состояние и (3) основное состояние первичного фотопродукта. Результаты моделирования прекрасно согласуются с экспериментальными данными с точки зрения квантового выхода, времëн достижения конического пересечения ППЭ и завершения квантовой эволюции, характеристического диапазона низких частот, сопровождающих процесс фотоизомеризации 11-цис ретиналя, а также когерентного характера реакции. Путëм анализа процесса диссипации показано эффективное перераспределение избыточной энергии между колебательными модами родопсина. Полученные результаты подтверждают правильность минимальной математической модели, несмотря на еë одномерный характер. Элементарность фотореакции и локальный характер смещений атомных групп впервые продемонстрированы при помощи элементарной математической модели.
Ключевые слова: родопсин, ретиналь, хромофор, цис-транс фотоизомеризация, квантово-классическая модель.
Финансовая поддержка Номер гранта
Российский фонд фундаментальных исследований 16-07-00305_а
17-00-00166_Комфи
Российская академия наук - Федеральное агентство научных организаций
Работа выполнена при поддержке Российского фонда фундаментальных исследований, проекты 16-07-00305-а и 17-00-00166-КОМФИ, и Программы фундаментальных исследований Президиума РАН «Наноструктуры: физика, химия, биология, основы технологий».
Тип публикации: Препринт
Язык публикации: английский
Образец цитирования: A. S. Shigaev, T. B. Feldman, V. A. Nadtochenko, M. A. Ostrovsky, V. D. Lakhno, “Quantum-classical modeling of rhodopsin photoisomerization”, Препринты ИПМ им. М. В. Келдыша, 2018, 027, 28 pp.
Цитирование в формате AMSBIB
\RBibitem{ShiFelNad18}
\by A.~S.~Shigaev, T.~B.~Feldman, V.~A.~Nadtochenko, M.~A.~Ostrovsky, V.~D.~Lakhno
\paper Quantum-classical modeling of rhodopsin photoisomerization
\jour Препринты ИПМ им.~М.~В.~Келдыша
\yr 2018
\papernumber 027
\totalpages 28
\mathnet{http://mi.mathnet.ru/ipmp2389}
\crossref{https://doi.org/10.20948/prepr-2018-27-e}
Образцы ссылок на эту страницу:
  • https://www.mathnet.ru/rus/ipmp2389
  • https://www.mathnet.ru/rus/ipmp/y2018/p27
  • Эта публикация цитируется в следующих 2 статьяx:
    Citing articles in Google Scholar: Russian citations, English citations
    Related articles in Google Scholar: Russian articles, English articles
    Препринты Института прикладной математики им. М. В. Келдыша РАН
    Статистика просмотров:
    Страница аннотации:268
    PDF полного текста:136
    Список литературы:19
     
      Обратная связь:
     Пользовательское соглашение  Регистрация посетителей портала  Логотипы © Математический институт им. В. А. Стеклова РАН, 2024